Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HJURPQ8NCD3 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HJURPQ8NCD3 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HJURPQ8NCD3 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HJURPQ8NCD3 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HJURPQ8NCD3 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HJURPQ8NCD3 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HJURPQ8NCD3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HJURPQ8NCD3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HJURPQ8NCD3 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
HJURPQ8NCD3 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HJURPQ8NCD3 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HJURPQ8NCD3 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HJURPQ8NCD3 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HJURPQ8NCD3 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HJURPQ8NCD3 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
HJURPQ8NCD3 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HJURPQ8NCD3 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HJURPQ8NCD3 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HJURPQ8NCD3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HJURPQ8NCD3 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HJURPQ8NCD3 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HJURPQ8NCD3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HJURPQ8NCD3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HJURPQ8NCD3 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HJURPQ8NCD3 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HJURPQ8NCD3 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HJURPQ8NCD3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HJURPQ8NCD3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HJURPQ8NCD3 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HJURPQ8NCD3 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HJURPQ8NCD3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HJURPQ8NCD3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HJURPQ8NCD3 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HJURPQ8NCD3 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HJURPQ8NCD3 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HJURPQ8NCD3 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HJURPQ8NCD3 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
HJURPQ8NCD3 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
HJURPQ8NCD3 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HJURPQ8NCD3 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
HJURPQ8NCD3 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HJURPQ8NCD3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HJURPQ8NCD3 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HJURPQ8NCD3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HJURPQ8NCD3 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HJURPQ8NCD3 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HJURPQ8NCD3 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HJURPQ8NCD3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HJURPQ8NCD3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
HJURPQ8NCD3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HJURPQ8NCD3 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HJURPQ8NCD3 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HJURPQ8NCD3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HJURPQ8NCD3 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HJURPQ8NCD3 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HJURPQ8NCD3 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HJURPQ8NCD3 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HJURPQ8NCD3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HJURPQ8NCD3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HJURPQ8NCD3 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HJURPQ8NCD3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HJURPQ8NCD3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HJURPQ8NCD3 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HJURPQ8NCD3 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HJURPQ8NCD3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HJURPQ8NCD3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HJURPQ8NCD3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HJURPQ8NCD3 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HJURPQ8NCD3 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HJURPQ8NCD3 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HJURPQ8NCD3 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HJURPQ8NCD3 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HJURPQ8NCD3 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HJURPQ8NCD3 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HJURPQ8NCD3 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
HJURPQ8NCD3 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HJURPQ8NCD3 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HJURPQ8NCD3 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HJURPQ8NCD3 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HJURPQ8NCD3 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HJURPQ8NCD3 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HJURPQ8NCD3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HJURPQ8NCD3 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HJURPQ8NCD3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HJURPQ8NCD3 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
HJURPQ8NCD3 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HJURPQ8NCD3 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HJURPQ8NCD3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HJURPQ8NCD3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HJURPQ8NCD3 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HJURPQ8NCD3 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HJURPQ8NCD3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HJURPQ8NCD3 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HJURPQ8NCD3 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HJURPQ8NCD3 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HJURPQ8NCD3 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HJURPQ8NCD3 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HJURPQ8NCD3 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HJURPQ8NCD3 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms