Protein–RNA interactions for Protein: Q8NC44

RETREG2, Reticulophagy regulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETREG2Q8NC44 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RETREG2Q8NC44 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RETREG2Q8NC44 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms