Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms