Protein–RNA interactions for Protein: Q8N427

NME8, Thioredoxin domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME8Q8N427 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NME8Q8N427 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NME8Q8N427 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NME8Q8N427 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NME8Q8N427 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NME8Q8N427 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NME8Q8N427 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NME8Q8N427 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NME8Q8N427 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NME8Q8N427 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NME8Q8N427 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NME8Q8N427 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NME8Q8N427 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NME8Q8N427 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NME8Q8N427 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NME8Q8N427 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NME8Q8N427 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NME8Q8N427 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NME8Q8N427 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NME8Q8N427 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NME8Q8N427 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NME8Q8N427 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NME8Q8N427 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NME8Q8N427 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NME8Q8N427 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NME8Q8N427 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NME8Q8N427 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NME8Q8N427 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NME8Q8N427 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NME8Q8N427 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NME8Q8N427 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NME8Q8N427 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NME8Q8N427 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NME8Q8N427 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NME8Q8N427 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NME8Q8N427 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NME8Q8N427 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NME8Q8N427 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NME8Q8N427 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NME8Q8N427 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NME8Q8N427 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NME8Q8N427 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NME8Q8N427 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NME8Q8N427 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NME8Q8N427 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NME8Q8N427 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NME8Q8N427 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NME8Q8N427 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NME8Q8N427 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NME8Q8N427 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NME8Q8N427 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NME8Q8N427 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NME8Q8N427 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NME8Q8N427 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NME8Q8N427 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NME8Q8N427 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NME8Q8N427 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NME8Q8N427 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NME8Q8N427 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NME8Q8N427 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NME8Q8N427 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NME8Q8N427 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NME8Q8N427 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NME8Q8N427 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NME8Q8N427 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NME8Q8N427 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NME8Q8N427 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NME8Q8N427 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NME8Q8N427 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NME8Q8N427 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NME8Q8N427 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NME8Q8N427 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NME8Q8N427 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NME8Q8N427 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NME8Q8N427 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NME8Q8N427 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NME8Q8N427 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NME8Q8N427 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NME8Q8N427 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NME8Q8N427 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NME8Q8N427 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NME8Q8N427 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NME8Q8N427 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NME8Q8N427 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NME8Q8N427 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NME8Q8N427 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NME8Q8N427 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NME8Q8N427 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NME8Q8N427 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NME8Q8N427 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NME8Q8N427 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NME8Q8N427 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NME8Q8N427 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NME8Q8N427 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NME8Q8N427 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NME8Q8N427 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NME8Q8N427 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NME8Q8N427 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NME8Q8N427 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NME8Q8N427 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
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