Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYR2

SMYD4, SET and MYND domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD4Q8IYR2 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMYD4Q8IYR2 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMYD4Q8IYR2 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMYD4Q8IYR2 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMYD4Q8IYR2 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMYD4Q8IYR2 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMYD4Q8IYR2 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMYD4Q8IYR2 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SMYD4Q8IYR2 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMYD4Q8IYR2 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMYD4Q8IYR2 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMYD4Q8IYR2 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMYD4Q8IYR2 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMYD4Q8IYR2 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMYD4Q8IYR2 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMYD4Q8IYR2 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMYD4Q8IYR2 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMYD4Q8IYR2 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMYD4Q8IYR2 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMYD4Q8IYR2 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMYD4Q8IYR2 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMYD4Q8IYR2 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMYD4Q8IYR2 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMYD4Q8IYR2 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMYD4Q8IYR2 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMYD4Q8IYR2 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMYD4Q8IYR2 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMYD4Q8IYR2 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMYD4Q8IYR2 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMYD4Q8IYR2 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMYD4Q8IYR2 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMYD4Q8IYR2 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMYD4Q8IYR2 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMYD4Q8IYR2 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMYD4Q8IYR2 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMYD4Q8IYR2 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMYD4Q8IYR2 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMYD4Q8IYR2 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMYD4Q8IYR2 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMYD4Q8IYR2 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMYD4Q8IYR2 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMYD4Q8IYR2 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMYD4Q8IYR2 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMYD4Q8IYR2 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMYD4Q8IYR2 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMYD4Q8IYR2 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMYD4Q8IYR2 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SMYD4Q8IYR2 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMYD4Q8IYR2 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SMYD4Q8IYR2 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMYD4Q8IYR2 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMYD4Q8IYR2 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMYD4Q8IYR2 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMYD4Q8IYR2 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMYD4Q8IYR2 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMYD4Q8IYR2 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMYD4Q8IYR2 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMYD4Q8IYR2 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMYD4Q8IYR2 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMYD4Q8IYR2 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMYD4Q8IYR2 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMYD4Q8IYR2 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMYD4Q8IYR2 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMYD4Q8IYR2 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMYD4Q8IYR2 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMYD4Q8IYR2 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMYD4Q8IYR2 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMYD4Q8IYR2 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMYD4Q8IYR2 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMYD4Q8IYR2 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMYD4Q8IYR2 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMYD4Q8IYR2 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMYD4Q8IYR2 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMYD4Q8IYR2 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMYD4Q8IYR2 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMYD4Q8IYR2 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMYD4Q8IYR2 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMYD4Q8IYR2 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMYD4Q8IYR2 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SMYD4Q8IYR2 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SMYD4Q8IYR2 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMYD4Q8IYR2 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMYD4Q8IYR2 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMYD4Q8IYR2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMYD4Q8IYR2 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMYD4Q8IYR2 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMYD4Q8IYR2 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMYD4Q8IYR2 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SMYD4Q8IYR2 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMYD4Q8IYR2 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMYD4Q8IYR2 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMYD4Q8IYR2 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMYD4Q8IYR2 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMYD4Q8IYR2 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMYD4Q8IYR2 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMYD4Q8IYR2 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMYD4Q8IYR2 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMYD4Q8IYR2 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMYD4Q8IYR2 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMYD4Q8IYR2 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms