Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SKAP1Q86WV1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SKAP1Q86WV1 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SKAP1Q86WV1 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SKAP1Q86WV1 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SKAP1Q86WV1 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SKAP1Q86WV1 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SKAP1Q86WV1 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SKAP1Q86WV1 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SKAP1Q86WV1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SKAP1Q86WV1 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SKAP1Q86WV1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SKAP1Q86WV1 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SKAP1Q86WV1 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SKAP1Q86WV1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SKAP1Q86WV1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SKAP1Q86WV1 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SKAP1Q86WV1 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SKAP1Q86WV1 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SKAP1Q86WV1 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SKAP1Q86WV1 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SKAP1Q86WV1 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SKAP1Q86WV1 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SKAP1Q86WV1 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SKAP1Q86WV1 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SKAP1Q86WV1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SKAP1Q86WV1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SKAP1Q86WV1 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SKAP1Q86WV1 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SKAP1Q86WV1 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SKAP1Q86WV1 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SKAP1Q86WV1 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SKAP1Q86WV1 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SKAP1Q86WV1 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SKAP1Q86WV1 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SKAP1Q86WV1 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SKAP1Q86WV1 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SKAP1Q86WV1 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SKAP1Q86WV1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SKAP1Q86WV1 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SKAP1Q86WV1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SKAP1Q86WV1 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SKAP1Q86WV1 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SKAP1Q86WV1 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SKAP1Q86WV1 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SKAP1Q86WV1 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SKAP1Q86WV1 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SKAP1Q86WV1 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SKAP1Q86WV1 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SKAP1Q86WV1 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SKAP1Q86WV1 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SKAP1Q86WV1 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SKAP1Q86WV1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SKAP1Q86WV1 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SKAP1Q86WV1 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SKAP1Q86WV1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SKAP1Q86WV1 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SKAP1Q86WV1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SKAP1Q86WV1 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SKAP1Q86WV1 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SKAP1Q86WV1 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SKAP1Q86WV1 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SKAP1Q86WV1 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SKAP1Q86WV1 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SKAP1Q86WV1 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SKAP1Q86WV1 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SKAP1Q86WV1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SKAP1Q86WV1 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SKAP1Q86WV1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SKAP1Q86WV1 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SKAP1Q86WV1 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SKAP1Q86WV1 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SKAP1Q86WV1 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SKAP1Q86WV1 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SKAP1Q86WV1 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SKAP1Q86WV1 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SKAP1Q86WV1 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SKAP1Q86WV1 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SKAP1Q86WV1 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SKAP1Q86WV1 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SKAP1Q86WV1 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SKAP1Q86WV1 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SKAP1Q86WV1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SKAP1Q86WV1 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SKAP1Q86WV1 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SKAP1Q86WV1 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SKAP1Q86WV1 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SKAP1Q86WV1 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SKAP1Q86WV1 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SKAP1Q86WV1 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SKAP1Q86WV1 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SKAP1Q86WV1 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SKAP1Q86WV1 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SKAP1Q86WV1 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SKAP1Q86WV1 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SKAP1Q86WV1 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SKAP1Q86WV1 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SKAP1Q86WV1 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SKAP1Q86WV1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SKAP1Q86WV1 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms