Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATG4DQ86TL0 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG4DQ86TL0 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms