Protein–RNA interactions for Protein: Q7L0J3

SV2A, Synaptic vesicle glycoprotein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2AQ7L0J3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SV2AQ7L0J3 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SV2AQ7L0J3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SV2AQ7L0J3 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SV2AQ7L0J3 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SV2AQ7L0J3 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SV2AQ7L0J3 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SV2AQ7L0J3 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SV2AQ7L0J3 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SV2AQ7L0J3 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SV2AQ7L0J3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SV2AQ7L0J3 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SV2AQ7L0J3 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SV2AQ7L0J3 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SV2AQ7L0J3 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SV2AQ7L0J3 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SV2AQ7L0J3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SV2AQ7L0J3 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SV2AQ7L0J3 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SV2AQ7L0J3 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SV2AQ7L0J3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SV2AQ7L0J3 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SV2AQ7L0J3 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SV2AQ7L0J3 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SV2AQ7L0J3 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SV2AQ7L0J3 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SV2AQ7L0J3 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SV2AQ7L0J3 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SV2AQ7L0J3 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SV2AQ7L0J3 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SV2AQ7L0J3 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SV2AQ7L0J3 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
SV2AQ7L0J3 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SV2AQ7L0J3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms