Protein–RNA interactions for Protein: Q76G19

PDZD4, PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD4Q76G19 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDZD4Q76G19 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDZD4Q76G19 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDZD4Q76G19 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDZD4Q76G19 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PDZD4Q76G19 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDZD4Q76G19 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDZD4Q76G19 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDZD4Q76G19 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDZD4Q76G19 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDZD4Q76G19 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDZD4Q76G19 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDZD4Q76G19 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDZD4Q76G19 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDZD4Q76G19 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PDZD4Q76G19 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDZD4Q76G19 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDZD4Q76G19 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDZD4Q76G19 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDZD4Q76G19 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDZD4Q76G19 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDZD4Q76G19 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDZD4Q76G19 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDZD4Q76G19 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDZD4Q76G19 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDZD4Q76G19 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDZD4Q76G19 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDZD4Q76G19 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDZD4Q76G19 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDZD4Q76G19 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDZD4Q76G19 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDZD4Q76G19 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDZD4Q76G19 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDZD4Q76G19 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDZD4Q76G19 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PDZD4Q76G19 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDZD4Q76G19 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDZD4Q76G19 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDZD4Q76G19 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms