Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

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Length 1,888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
UBR3Q6ZT12 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBR3Q6ZT12 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBR3Q6ZT12 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBR3Q6ZT12 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBR3Q6ZT12 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBR3Q6ZT12 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBR3Q6ZT12 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBR3Q6ZT12 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBR3Q6ZT12 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBR3Q6ZT12 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBR3Q6ZT12 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBR3Q6ZT12 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBR3Q6ZT12 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBR3Q6ZT12 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
UBR3Q6ZT12 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBR3Q6ZT12 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBR3Q6ZT12 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBR3Q6ZT12 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBR3Q6ZT12 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBR3Q6ZT12 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBR3Q6ZT12 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBR3Q6ZT12 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBR3Q6ZT12 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBR3Q6ZT12 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBR3Q6ZT12 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
UBR3Q6ZT12 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
UBR3Q6ZT12 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBR3Q6ZT12 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBR3Q6ZT12 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBR3Q6ZT12 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBR3Q6ZT12 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBR3Q6ZT12 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBR3Q6ZT12 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
UBR3Q6ZT12 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBR3Q6ZT12 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBR3Q6ZT12 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBR3Q6ZT12 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBR3Q6ZT12 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
UBR3Q6ZT12 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
UBR3Q6ZT12 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
UBR3Q6ZT12 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBR3Q6ZT12 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBR3Q6ZT12 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBR3Q6ZT12 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBR3Q6ZT12 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBR3Q6ZT12 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBR3Q6ZT12 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBR3Q6ZT12 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBR3Q6ZT12 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
UBR3Q6ZT12 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBR3Q6ZT12 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBR3Q6ZT12 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBR3Q6ZT12 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBR3Q6ZT12 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
UBR3Q6ZT12 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
UBR3Q6ZT12 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBR3Q6ZT12 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
UBR3Q6ZT12 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBR3Q6ZT12 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBR3Q6ZT12 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
UBR3Q6ZT12 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBR3Q6ZT12 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBR3Q6ZT12 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBR3Q6ZT12 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBR3Q6ZT12 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBR3Q6ZT12 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBR3Q6ZT12 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBR3Q6ZT12 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
UBR3Q6ZT12 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
UBR3Q6ZT12 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBR3Q6ZT12 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBR3Q6ZT12 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBR3Q6ZT12 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBR3Q6ZT12 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBR3Q6ZT12 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBR3Q6ZT12 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBR3Q6ZT12 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBR3Q6ZT12 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
UBR3Q6ZT12 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBR3Q6ZT12 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBR3Q6ZT12 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBR3Q6ZT12 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBR3Q6ZT12 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBR3Q6ZT12 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBR3Q6ZT12 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBR3Q6ZT12 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBR3Q6ZT12 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBR3Q6ZT12 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
UBR3Q6ZT12 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBR3Q6ZT12 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBR3Q6ZT12 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBR3Q6ZT12 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBR3Q6ZT12 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBR3Q6ZT12 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBR3Q6ZT12 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBR3Q6ZT12 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBR3Q6ZT12 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBR3Q6ZT12 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBR3Q6ZT12 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
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