Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZBED9Q6R2W3 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZBED9Q6R2W3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
ZBED9Q6R2W3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
ZBED9Q6R2W3 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZBED9Q6R2W3 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZBED9Q6R2W3 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZBED9Q6R2W3 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZBED9Q6R2W3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZBED9Q6R2W3 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZBED9Q6R2W3 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZBED9Q6R2W3 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZBED9Q6R2W3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZBED9Q6R2W3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZBED9Q6R2W3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
ZBED9Q6R2W3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZBED9Q6R2W3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
ZBED9Q6R2W3 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZBED9Q6R2W3 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZBED9Q6R2W3 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZBED9Q6R2W3 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZBED9Q6R2W3 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZBED9Q6R2W3 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZBED9Q6R2W3 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
ZBED9Q6R2W3 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZBED9Q6R2W3 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZBED9Q6R2W3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZBED9Q6R2W3 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZBED9Q6R2W3 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
ZBED9Q6R2W3 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZBED9Q6R2W3 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZBED9Q6R2W3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZBED9Q6R2W3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZBED9Q6R2W3 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZBED9Q6R2W3 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZBED9Q6R2W3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZBED9Q6R2W3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZBED9Q6R2W3 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZBED9Q6R2W3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZBED9Q6R2W3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZBED9Q6R2W3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZBED9Q6R2W3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZBED9Q6R2W3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZBED9Q6R2W3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZBED9Q6R2W3 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZBED9Q6R2W3 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZBED9Q6R2W3 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZBED9Q6R2W3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZBED9Q6R2W3 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZBED9Q6R2W3 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZBED9Q6R2W3 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZBED9Q6R2W3 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
ZBED9Q6R2W3 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZBED9Q6R2W3 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZBED9Q6R2W3 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZBED9Q6R2W3 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZBED9Q6R2W3 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZBED9Q6R2W3 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZBED9Q6R2W3 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZBED9Q6R2W3 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
ZBED9Q6R2W3 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
ZBED9Q6R2W3 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZBED9Q6R2W3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZBED9Q6R2W3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZBED9Q6R2W3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZBED9Q6R2W3 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZBED9Q6R2W3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZBED9Q6R2W3 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZBED9Q6R2W3 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZBED9Q6R2W3 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZBED9Q6R2W3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZBED9Q6R2W3 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZBED9Q6R2W3 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZBED9Q6R2W3 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
ZBED9Q6R2W3 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZBED9Q6R2W3 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZBED9Q6R2W3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZBED9Q6R2W3 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZBED9Q6R2W3 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZBED9Q6R2W3 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZBED9Q6R2W3 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZBED9Q6R2W3 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZBED9Q6R2W3 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZBED9Q6R2W3 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZBED9Q6R2W3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZBED9Q6R2W3 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
ZBED9Q6R2W3 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZBED9Q6R2W3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZBED9Q6R2W3 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZBED9Q6R2W3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZBED9Q6R2W3 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZBED9Q6R2W3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZBED9Q6R2W3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZBED9Q6R2W3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZBED9Q6R2W3 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZBED9Q6R2W3 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZBED9Q6R2W3 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZBED9Q6R2W3 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZBED9Q6R2W3 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZBED9Q6R2W3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
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