Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF7

APOBEC3H, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3H, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3HQ6NTF7 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
APOBEC3HQ6NTF7 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
APOBEC3HQ6NTF7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
APOBEC3HQ6NTF7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
APOBEC3HQ6NTF7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
APOBEC3HQ6NTF7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
APOBEC3HQ6NTF7 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
APOBEC3HQ6NTF7 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
APOBEC3HQ6NTF7 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
APOBEC3HQ6NTF7 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
APOBEC3HQ6NTF7 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
APOBEC3HQ6NTF7 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
APOBEC3HQ6NTF7 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
APOBEC3HQ6NTF7 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
APOBEC3HQ6NTF7 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24■■□□□ 1.43
APOBEC3HQ6NTF7 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC24■■□□□ 1.43
APOBEC3HQ6NTF7 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC24■■□□□ 1.43
APOBEC3HQ6NTF7 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
APOBEC3HQ6NTF7 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
APOBEC3HQ6NTF7 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
APOBEC3HQ6NTF7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
APOBEC3HQ6NTF7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
APOBEC3HQ6NTF7 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
APOBEC3HQ6NTF7 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
APOBEC3HQ6NTF7 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
APOBEC3HQ6NTF7 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
APOBEC3HQ6NTF7 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
APOBEC3HQ6NTF7 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
APOBEC3HQ6NTF7 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
APOBEC3HQ6NTF7 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
APOBEC3HQ6NTF7 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
APOBEC3HQ6NTF7 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
APOBEC3HQ6NTF7 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
APOBEC3HQ6NTF7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
APOBEC3HQ6NTF7 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
APOBEC3HQ6NTF7 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
APOBEC3HQ6NTF7 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
APOBEC3HQ6NTF7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
APOBEC3HQ6NTF7 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
APOBEC3HQ6NTF7 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
APOBEC3HQ6NTF7 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
APOBEC3HQ6NTF7 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
APOBEC3HQ6NTF7 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
APOBEC3HQ6NTF7 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
APOBEC3HQ6NTF7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
APOBEC3HQ6NTF7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
APOBEC3HQ6NTF7 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
APOBEC3HQ6NTF7 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
APOBEC3HQ6NTF7 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
APOBEC3HQ6NTF7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
APOBEC3HQ6NTF7 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
APOBEC3HQ6NTF7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
APOBEC3HQ6NTF7 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
APOBEC3HQ6NTF7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
APOBEC3HQ6NTF7 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
APOBEC3HQ6NTF7 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
APOBEC3HQ6NTF7 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
APOBEC3HQ6NTF7 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
APOBEC3HQ6NTF7 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
APOBEC3HQ6NTF7 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
APOBEC3HQ6NTF7 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
APOBEC3HQ6NTF7 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
APOBEC3HQ6NTF7 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
APOBEC3HQ6NTF7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
APOBEC3HQ6NTF7 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOBEC3HQ6NTF7 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOBEC3HQ6NTF7 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOBEC3HQ6NTF7 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOBEC3HQ6NTF7 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOBEC3HQ6NTF7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOBEC3HQ6NTF7 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOBEC3HQ6NTF7 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOBEC3HQ6NTF7 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOBEC3HQ6NTF7 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOBEC3HQ6NTF7 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
APOBEC3HQ6NTF7 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
APOBEC3HQ6NTF7 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.43
APOBEC3HQ6NTF7 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
APOBEC3HQ6NTF7 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
APOBEC3HQ6NTF7 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
APOBEC3HQ6NTF7 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
APOBEC3HQ6NTF7 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
APOBEC3HQ6NTF7 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
APOBEC3HQ6NTF7 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
APOBEC3HQ6NTF7 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
APOBEC3HQ6NTF7 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
APOBEC3HQ6NTF7 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
APOBEC3HQ6NTF7 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
APOBEC3HQ6NTF7 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
APOBEC3HQ6NTF7 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
APOBEC3HQ6NTF7 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
APOBEC3HQ6NTF7 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
APOBEC3HQ6NTF7 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
APOBEC3HQ6NTF7 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
APOBEC3HQ6NTF7 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
APOBEC3HQ6NTF7 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
APOBEC3HQ6NTF7 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
APOBEC3HQ6NTF7 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
APOBEC3HQ6NTF7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms