Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LRRC8EQ6NSJ5 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LRRC8EQ6NSJ5 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LRRC8EQ6NSJ5 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LRRC8EQ6NSJ5 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LRRC8EQ6NSJ5 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRRC8EQ6NSJ5 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRRC8EQ6NSJ5 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRRC8EQ6NSJ5 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRRC8EQ6NSJ5 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRRC8EQ6NSJ5 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRRC8EQ6NSJ5 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRRC8EQ6NSJ5 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRRC8EQ6NSJ5 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRRC8EQ6NSJ5 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRRC8EQ6NSJ5 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRRC8EQ6NSJ5 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRRC8EQ6NSJ5 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRRC8EQ6NSJ5 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRRC8EQ6NSJ5 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRRC8EQ6NSJ5 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRRC8EQ6NSJ5 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRRC8EQ6NSJ5 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRRC8EQ6NSJ5 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRRC8EQ6NSJ5 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRRC8EQ6NSJ5 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRRC8EQ6NSJ5 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRRC8EQ6NSJ5 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRRC8EQ6NSJ5 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRRC8EQ6NSJ5 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRRC8EQ6NSJ5 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRRC8EQ6NSJ5 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRRC8EQ6NSJ5 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRRC8EQ6NSJ5 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRRC8EQ6NSJ5 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRRC8EQ6NSJ5 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRRC8EQ6NSJ5 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRRC8EQ6NSJ5 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRRC8EQ6NSJ5 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
LRRC8EQ6NSJ5 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRRC8EQ6NSJ5 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRRC8EQ6NSJ5 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRRC8EQ6NSJ5 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRRC8EQ6NSJ5 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRRC8EQ6NSJ5 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
LRRC8EQ6NSJ5 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRRC8EQ6NSJ5 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRRC8EQ6NSJ5 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRRC8EQ6NSJ5 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRRC8EQ6NSJ5 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRRC8EQ6NSJ5 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRRC8EQ6NSJ5 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRRC8EQ6NSJ5 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LRRC8EQ6NSJ5 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LRRC8EQ6NSJ5 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LRRC8EQ6NSJ5 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LRRC8EQ6NSJ5 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LRRC8EQ6NSJ5 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LRRC8EQ6NSJ5 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LRRC8EQ6NSJ5 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LRRC8EQ6NSJ5 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LRRC8EQ6NSJ5 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LRRC8EQ6NSJ5 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LRRC8EQ6NSJ5 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LRRC8EQ6NSJ5 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LRRC8EQ6NSJ5 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
LRRC8EQ6NSJ5 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LRRC8EQ6NSJ5 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LRRC8EQ6NSJ5 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LRRC8EQ6NSJ5 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LRRC8EQ6NSJ5 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LRRC8EQ6NSJ5 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LRRC8EQ6NSJ5 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LRRC8EQ6NSJ5 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LRRC8EQ6NSJ5 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LRRC8EQ6NSJ5 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LRRC8EQ6NSJ5 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LRRC8EQ6NSJ5 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LRRC8EQ6NSJ5 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LRRC8EQ6NSJ5 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LRRC8EQ6NSJ5 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LRRC8EQ6NSJ5 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LRRC8EQ6NSJ5 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LRRC8EQ6NSJ5 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LRRC8EQ6NSJ5 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LRRC8EQ6NSJ5 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LRRC8EQ6NSJ5 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
LRRC8EQ6NSJ5 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LRRC8EQ6NSJ5 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LRRC8EQ6NSJ5 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LRRC8EQ6NSJ5 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LRRC8EQ6NSJ5 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LRRC8EQ6NSJ5 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LRRC8EQ6NSJ5 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms