Protein–RNA interactions for Protein: Q6IBW4

NCAPH2, Condensin-2 complex subunit H2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPH2Q6IBW4 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCAPH2Q6IBW4 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCAPH2Q6IBW4 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCAPH2Q6IBW4 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCAPH2Q6IBW4 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCAPH2Q6IBW4 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCAPH2Q6IBW4 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCAPH2Q6IBW4 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCAPH2Q6IBW4 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCAPH2Q6IBW4 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCAPH2Q6IBW4 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCAPH2Q6IBW4 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCAPH2Q6IBW4 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCAPH2Q6IBW4 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCAPH2Q6IBW4 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCAPH2Q6IBW4 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCAPH2Q6IBW4 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCAPH2Q6IBW4 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCAPH2Q6IBW4 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCAPH2Q6IBW4 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCAPH2Q6IBW4 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCAPH2Q6IBW4 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCAPH2Q6IBW4 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCAPH2Q6IBW4 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCAPH2Q6IBW4 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCAPH2Q6IBW4 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCAPH2Q6IBW4 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCAPH2Q6IBW4 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCAPH2Q6IBW4 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCAPH2Q6IBW4 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCAPH2Q6IBW4 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCAPH2Q6IBW4 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCAPH2Q6IBW4 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCAPH2Q6IBW4 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCAPH2Q6IBW4 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCAPH2Q6IBW4 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCAPH2Q6IBW4 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCAPH2Q6IBW4 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCAPH2Q6IBW4 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NCAPH2Q6IBW4 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCAPH2Q6IBW4 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCAPH2Q6IBW4 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NCAPH2Q6IBW4 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCAPH2Q6IBW4 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCAPH2Q6IBW4 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCAPH2Q6IBW4 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCAPH2Q6IBW4 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCAPH2Q6IBW4 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCAPH2Q6IBW4 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCAPH2Q6IBW4 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCAPH2Q6IBW4 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NCAPH2Q6IBW4 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCAPH2Q6IBW4 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCAPH2Q6IBW4 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCAPH2Q6IBW4 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCAPH2Q6IBW4 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCAPH2Q6IBW4 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCAPH2Q6IBW4 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCAPH2Q6IBW4 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCAPH2Q6IBW4 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCAPH2Q6IBW4 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCAPH2Q6IBW4 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCAPH2Q6IBW4 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCAPH2Q6IBW4 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCAPH2Q6IBW4 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCAPH2Q6IBW4 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCAPH2Q6IBW4 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCAPH2Q6IBW4 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCAPH2Q6IBW4 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCAPH2Q6IBW4 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCAPH2Q6IBW4 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCAPH2Q6IBW4 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCAPH2Q6IBW4 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCAPH2Q6IBW4 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCAPH2Q6IBW4 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCAPH2Q6IBW4 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCAPH2Q6IBW4 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCAPH2Q6IBW4 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCAPH2Q6IBW4 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCAPH2Q6IBW4 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCAPH2Q6IBW4 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCAPH2Q6IBW4 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCAPH2Q6IBW4 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NCAPH2Q6IBW4 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NCAPH2Q6IBW4 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NCAPH2Q6IBW4 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NCAPH2Q6IBW4 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NCAPH2Q6IBW4 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NCAPH2Q6IBW4 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCAPH2Q6IBW4 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCAPH2Q6IBW4 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCAPH2Q6IBW4 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCAPH2Q6IBW4 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCAPH2Q6IBW4 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCAPH2Q6IBW4 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCAPH2Q6IBW4 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCAPH2Q6IBW4 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCAPH2Q6IBW4 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCAPH2Q6IBW4 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCAPH2Q6IBW4 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms