Protein–RNA interactions for Protein: Q6DN14

MCTP1, Multiple C2 and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCTP1Q6DN14 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCTP1Q6DN14 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCTP1Q6DN14 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCTP1Q6DN14 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCTP1Q6DN14 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MCTP1Q6DN14 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MCTP1Q6DN14 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MCTP1Q6DN14 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MCTP1Q6DN14 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MCTP1Q6DN14 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MCTP1Q6DN14 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MCTP1Q6DN14 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MCTP1Q6DN14 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MCTP1Q6DN14 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MCTP1Q6DN14 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MCTP1Q6DN14 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MCTP1Q6DN14 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MCTP1Q6DN14 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MCTP1Q6DN14 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MCTP1Q6DN14 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MCTP1Q6DN14 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MCTP1Q6DN14 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MCTP1Q6DN14 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MCTP1Q6DN14 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCTP1Q6DN14 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCTP1Q6DN14 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCTP1Q6DN14 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCTP1Q6DN14 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCTP1Q6DN14 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCTP1Q6DN14 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCTP1Q6DN14 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCTP1Q6DN14 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCTP1Q6DN14 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCTP1Q6DN14 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCTP1Q6DN14 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCTP1Q6DN14 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCTP1Q6DN14 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCTP1Q6DN14 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCTP1Q6DN14 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCTP1Q6DN14 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCTP1Q6DN14 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCTP1Q6DN14 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCTP1Q6DN14 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCTP1Q6DN14 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCTP1Q6DN14 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCTP1Q6DN14 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCTP1Q6DN14 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCTP1Q6DN14 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCTP1Q6DN14 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCTP1Q6DN14 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCTP1Q6DN14 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCTP1Q6DN14 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCTP1Q6DN14 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCTP1Q6DN14 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCTP1Q6DN14 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCTP1Q6DN14 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCTP1Q6DN14 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCTP1Q6DN14 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCTP1Q6DN14 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCTP1Q6DN14 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCTP1Q6DN14 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCTP1Q6DN14 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCTP1Q6DN14 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCTP1Q6DN14 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MCTP1Q6DN14 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MCTP1Q6DN14 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MCTP1Q6DN14 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MCTP1Q6DN14 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MCTP1Q6DN14 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MCTP1Q6DN14 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MCTP1Q6DN14 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MCTP1Q6DN14 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MCTP1Q6DN14 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MCTP1Q6DN14 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MCTP1Q6DN14 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MCTP1Q6DN14 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MCTP1Q6DN14 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MCTP1Q6DN14 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MCTP1Q6DN14 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MCTP1Q6DN14 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MCTP1Q6DN14 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MCTP1Q6DN14 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MCTP1Q6DN14 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MCTP1Q6DN14 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MCTP1Q6DN14 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCTP1Q6DN14 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCTP1Q6DN14 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCTP1Q6DN14 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCTP1Q6DN14 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCTP1Q6DN14 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCTP1Q6DN14 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
MCTP1Q6DN14 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCTP1Q6DN14 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCTP1Q6DN14 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCTP1Q6DN14 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCTP1Q6DN14 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
MCTP1Q6DN14 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCTP1Q6DN14 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCTP1Q6DN14 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
MCTP1Q6DN14 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms