Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms