Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUE5

C1orf53, Uncharacterized protein C1orf53, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf53Q5VUE5 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1orf53Q5VUE5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C1orf53Q5VUE5 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
C1orf53Q5VUE5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1orf53Q5VUE5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1orf53Q5VUE5 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1orf53Q5VUE5 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1orf53Q5VUE5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1orf53Q5VUE5 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1orf53Q5VUE5 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1orf53Q5VUE5 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1orf53Q5VUE5 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1orf53Q5VUE5 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1orf53Q5VUE5 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1orf53Q5VUE5 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1orf53Q5VUE5 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
C1orf53Q5VUE5 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1orf53Q5VUE5 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1orf53Q5VUE5 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1orf53Q5VUE5 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1orf53Q5VUE5 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
C1orf53Q5VUE5 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1orf53Q5VUE5 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1orf53Q5VUE5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1orf53Q5VUE5 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1orf53Q5VUE5 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1orf53Q5VUE5 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1orf53Q5VUE5 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1orf53Q5VUE5 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1orf53Q5VUE5 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1orf53Q5VUE5 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1orf53Q5VUE5 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1orf53Q5VUE5 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1orf53Q5VUE5 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
C1orf53Q5VUE5 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1orf53Q5VUE5 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1orf53Q5VUE5 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
C1orf53Q5VUE5 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1orf53Q5VUE5 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
C1orf53Q5VUE5 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1orf53Q5VUE5 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1orf53Q5VUE5 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1orf53Q5VUE5 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1orf53Q5VUE5 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1orf53Q5VUE5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1orf53Q5VUE5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1orf53Q5VUE5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1orf53Q5VUE5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1orf53Q5VUE5 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1orf53Q5VUE5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1orf53Q5VUE5 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1orf53Q5VUE5 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1orf53Q5VUE5 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1orf53Q5VUE5 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1orf53Q5VUE5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1orf53Q5VUE5 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1orf53Q5VUE5 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1orf53Q5VUE5 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1orf53Q5VUE5 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
C1orf53Q5VUE5 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
C1orf53Q5VUE5 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1orf53Q5VUE5 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1orf53Q5VUE5 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1orf53Q5VUE5 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
C1orf53Q5VUE5 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
C1orf53Q5VUE5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1orf53Q5VUE5 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1orf53Q5VUE5 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1orf53Q5VUE5 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
C1orf53Q5VUE5 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1orf53Q5VUE5 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1orf53Q5VUE5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1orf53Q5VUE5 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1orf53Q5VUE5 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1orf53Q5VUE5 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1orf53Q5VUE5 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1orf53Q5VUE5 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1orf53Q5VUE5 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1orf53Q5VUE5 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1orf53Q5VUE5 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1orf53Q5VUE5 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1orf53Q5VUE5 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1orf53Q5VUE5 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1orf53Q5VUE5 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1orf53Q5VUE5 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1orf53Q5VUE5 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
C1orf53Q5VUE5 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1orf53Q5VUE5 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1orf53Q5VUE5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1orf53Q5VUE5 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1orf53Q5VUE5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1orf53Q5VUE5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1orf53Q5VUE5 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1orf53Q5VUE5 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1orf53Q5VUE5 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1orf53Q5VUE5 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1orf53Q5VUE5 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1orf53Q5VUE5 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1orf53Q5VUE5 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1orf53Q5VUE5 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.6 ms