Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
STRIP1Q5VSL9 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STRIP1Q5VSL9 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STRIP1Q5VSL9 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
STRIP1Q5VSL9 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STRIP1Q5VSL9 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STRIP1Q5VSL9 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STRIP1Q5VSL9 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STRIP1Q5VSL9 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STRIP1Q5VSL9 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STRIP1Q5VSL9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STRIP1Q5VSL9 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STRIP1Q5VSL9 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STRIP1Q5VSL9 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
STRIP1Q5VSL9 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STRIP1Q5VSL9 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STRIP1Q5VSL9 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
STRIP1Q5VSL9 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
STRIP1Q5VSL9 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STRIP1Q5VSL9 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
STRIP1Q5VSL9 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STRIP1Q5VSL9 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
STRIP1Q5VSL9 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
STRIP1Q5VSL9 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
STRIP1Q5VSL9 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
STRIP1Q5VSL9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STRIP1Q5VSL9 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRIP1Q5VSL9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRIP1Q5VSL9 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRIP1Q5VSL9 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRIP1Q5VSL9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRIP1Q5VSL9 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRIP1Q5VSL9 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRIP1Q5VSL9 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRIP1Q5VSL9 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
STRIP1Q5VSL9 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRIP1Q5VSL9 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRIP1Q5VSL9 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRIP1Q5VSL9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRIP1Q5VSL9 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRIP1Q5VSL9 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
STRIP1Q5VSL9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
STRIP1Q5VSL9 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
STRIP1Q5VSL9 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
STRIP1Q5VSL9 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
STRIP1Q5VSL9 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
STRIP1Q5VSL9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
STRIP1Q5VSL9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
STRIP1Q5VSL9 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
STRIP1Q5VSL9 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
STRIP1Q5VSL9 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
STRIP1Q5VSL9 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
STRIP1Q5VSL9 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
STRIP1Q5VSL9 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
STRIP1Q5VSL9 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
STRIP1Q5VSL9 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
STRIP1Q5VSL9 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
STRIP1Q5VSL9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
STRIP1Q5VSL9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
STRIP1Q5VSL9 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
STRIP1Q5VSL9 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRIP1Q5VSL9 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRIP1Q5VSL9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRIP1Q5VSL9 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRIP1Q5VSL9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRIP1Q5VSL9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRIP1Q5VSL9 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRIP1Q5VSL9 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRIP1Q5VSL9 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRIP1Q5VSL9 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
STRIP1Q5VSL9 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRIP1Q5VSL9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRIP1Q5VSL9 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRIP1Q5VSL9 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRIP1Q5VSL9 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRIP1Q5VSL9 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRIP1Q5VSL9 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRIP1Q5VSL9 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
STRIP1Q5VSL9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STRIP1Q5VSL9 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STRIP1Q5VSL9 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STRIP1Q5VSL9 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STRIP1Q5VSL9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STRIP1Q5VSL9 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STRIP1Q5VSL9 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STRIP1Q5VSL9 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STRIP1Q5VSL9 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
STRIP1Q5VSL9 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
STRIP1Q5VSL9 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STRIP1Q5VSL9 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
STRIP1Q5VSL9 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
STRIP1Q5VSL9 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STRIP1Q5VSL9 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
STRIP1Q5VSL9 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
STRIP1Q5VSL9 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
STRIP1Q5VSL9 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
STRIP1Q5VSL9 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
STRIP1Q5VSL9 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
STRIP1Q5VSL9 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
STRIP1Q5VSL9 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms