Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7N2

L1TD1, LINE-1 type transposase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 865 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1TD1Q5T7N2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
L1TD1Q5T7N2 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
L1TD1Q5T7N2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
L1TD1Q5T7N2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
L1TD1Q5T7N2 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
L1TD1Q5T7N2 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
L1TD1Q5T7N2 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
L1TD1Q5T7N2 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
L1TD1Q5T7N2 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
L1TD1Q5T7N2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
L1TD1Q5T7N2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
L1TD1Q5T7N2 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
L1TD1Q5T7N2 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
L1TD1Q5T7N2 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
L1TD1Q5T7N2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
L1TD1Q5T7N2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
L1TD1Q5T7N2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
L1TD1Q5T7N2 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
L1TD1Q5T7N2 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
L1TD1Q5T7N2 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
L1TD1Q5T7N2 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
L1TD1Q5T7N2 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
L1TD1Q5T7N2 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
L1TD1Q5T7N2 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
L1TD1Q5T7N2 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
L1TD1Q5T7N2 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
L1TD1Q5T7N2 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
L1TD1Q5T7N2 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
L1TD1Q5T7N2 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
L1TD1Q5T7N2 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
L1TD1Q5T7N2 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
L1TD1Q5T7N2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
L1TD1Q5T7N2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
L1TD1Q5T7N2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
L1TD1Q5T7N2 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
L1TD1Q5T7N2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
L1TD1Q5T7N2 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
L1TD1Q5T7N2 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
L1TD1Q5T7N2 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
L1TD1Q5T7N2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
L1TD1Q5T7N2 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
L1TD1Q5T7N2 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
L1TD1Q5T7N2 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
L1TD1Q5T7N2 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
L1TD1Q5T7N2 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
L1TD1Q5T7N2 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
L1TD1Q5T7N2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
L1TD1Q5T7N2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
L1TD1Q5T7N2 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
L1TD1Q5T7N2 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
L1TD1Q5T7N2 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
L1TD1Q5T7N2 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
L1TD1Q5T7N2 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
L1TD1Q5T7N2 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
L1TD1Q5T7N2 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
L1TD1Q5T7N2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
L1TD1Q5T7N2 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
L1TD1Q5T7N2 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
L1TD1Q5T7N2 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
L1TD1Q5T7N2 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
L1TD1Q5T7N2 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
L1TD1Q5T7N2 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
L1TD1Q5T7N2 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
L1TD1Q5T7N2 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
L1TD1Q5T7N2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
L1TD1Q5T7N2 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
L1TD1Q5T7N2 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
L1TD1Q5T7N2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
L1TD1Q5T7N2 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
L1TD1Q5T7N2 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
L1TD1Q5T7N2 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
L1TD1Q5T7N2 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
L1TD1Q5T7N2 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
L1TD1Q5T7N2 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
L1TD1Q5T7N2 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
L1TD1Q5T7N2 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
L1TD1Q5T7N2 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
L1TD1Q5T7N2 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
L1TD1Q5T7N2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
L1TD1Q5T7N2 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
L1TD1Q5T7N2 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
L1TD1Q5T7N2 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
L1TD1Q5T7N2 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
L1TD1Q5T7N2 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
L1TD1Q5T7N2 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
L1TD1Q5T7N2 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
L1TD1Q5T7N2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
L1TD1Q5T7N2 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
L1TD1Q5T7N2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
L1TD1Q5T7N2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
L1TD1Q5T7N2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
L1TD1Q5T7N2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
L1TD1Q5T7N2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
L1TD1Q5T7N2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
L1TD1Q5T7N2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
L1TD1Q5T7N2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
L1TD1Q5T7N2 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
L1TD1Q5T7N2 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
L1TD1Q5T7N2 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
L1TD1Q5T7N2 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms