Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0J3

C1orf220, Putative uncharacterized protein C1orf220, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf220Q5T0J3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C1orf220Q5T0J3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C1orf220Q5T0J3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C1orf220Q5T0J3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C1orf220Q5T0J3 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C1orf220Q5T0J3 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
C1orf220Q5T0J3 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C1orf220Q5T0J3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C1orf220Q5T0J3 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C1orf220Q5T0J3 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C1orf220Q5T0J3 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C1orf220Q5T0J3 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C1orf220Q5T0J3 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C1orf220Q5T0J3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C1orf220Q5T0J3 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C1orf220Q5T0J3 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C1orf220Q5T0J3 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C1orf220Q5T0J3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C1orf220Q5T0J3 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C1orf220Q5T0J3 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C1orf220Q5T0J3 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C1orf220Q5T0J3 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C1orf220Q5T0J3 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C1orf220Q5T0J3 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
C1orf220Q5T0J3 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
C1orf220Q5T0J3 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C1orf220Q5T0J3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C1orf220Q5T0J3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C1orf220Q5T0J3 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
C1orf220Q5T0J3 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
C1orf220Q5T0J3 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C1orf220Q5T0J3 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C1orf220Q5T0J3 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C1orf220Q5T0J3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C1orf220Q5T0J3 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C1orf220Q5T0J3 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C1orf220Q5T0J3 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C1orf220Q5T0J3 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C1orf220Q5T0J3 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C1orf220Q5T0J3 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C1orf220Q5T0J3 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C1orf220Q5T0J3 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C1orf220Q5T0J3 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C1orf220Q5T0J3 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C1orf220Q5T0J3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C1orf220Q5T0J3 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C1orf220Q5T0J3 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C1orf220Q5T0J3 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C1orf220Q5T0J3 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C1orf220Q5T0J3 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C1orf220Q5T0J3 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C1orf220Q5T0J3 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
C1orf220Q5T0J3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C1orf220Q5T0J3 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C1orf220Q5T0J3 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C1orf220Q5T0J3 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C1orf220Q5T0J3 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C1orf220Q5T0J3 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C1orf220Q5T0J3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C1orf220Q5T0J3 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C1orf220Q5T0J3 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C1orf220Q5T0J3 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C1orf220Q5T0J3 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C1orf220Q5T0J3 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C1orf220Q5T0J3 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C1orf220Q5T0J3 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C1orf220Q5T0J3 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C1orf220Q5T0J3 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C1orf220Q5T0J3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C1orf220Q5T0J3 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
C1orf220Q5T0J3 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C1orf220Q5T0J3 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C1orf220Q5T0J3 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C1orf220Q5T0J3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C1orf220Q5T0J3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C1orf220Q5T0J3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C1orf220Q5T0J3 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
C1orf220Q5T0J3 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
C1orf220Q5T0J3 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C1orf220Q5T0J3 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C1orf220Q5T0J3 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C1orf220Q5T0J3 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C1orf220Q5T0J3 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C1orf220Q5T0J3 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C1orf220Q5T0J3 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C1orf220Q5T0J3 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
C1orf220Q5T0J3 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C1orf220Q5T0J3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C1orf220Q5T0J3 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C1orf220Q5T0J3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C1orf220Q5T0J3 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C1orf220Q5T0J3 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C1orf220Q5T0J3 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C1orf220Q5T0J3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C1orf220Q5T0J3 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C1orf220Q5T0J3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C1orf220Q5T0J3 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C1orf220Q5T0J3 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C1orf220Q5T0J3 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C1orf220Q5T0J3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms