Protein–RNA interactions for Protein: Q5PRF9

SAMD4B, Protein Smaug homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD4BQ5PRF9 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SAMD4BQ5PRF9 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SAMD4BQ5PRF9 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SAMD4BQ5PRF9 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SAMD4BQ5PRF9 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SAMD4BQ5PRF9 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SAMD4BQ5PRF9 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SAMD4BQ5PRF9 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SAMD4BQ5PRF9 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SAMD4BQ5PRF9 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SAMD4BQ5PRF9 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SAMD4BQ5PRF9 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SAMD4BQ5PRF9 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SAMD4BQ5PRF9 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SAMD4BQ5PRF9 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SAMD4BQ5PRF9 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SAMD4BQ5PRF9 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SAMD4BQ5PRF9 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SAMD4BQ5PRF9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SAMD4BQ5PRF9 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SAMD4BQ5PRF9 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SAMD4BQ5PRF9 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SAMD4BQ5PRF9 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SAMD4BQ5PRF9 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SAMD4BQ5PRF9 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SAMD4BQ5PRF9 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SAMD4BQ5PRF9 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SAMD4BQ5PRF9 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SAMD4BQ5PRF9 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SAMD4BQ5PRF9 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SAMD4BQ5PRF9 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SAMD4BQ5PRF9 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SAMD4BQ5PRF9 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SAMD4BQ5PRF9 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SAMD4BQ5PRF9 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SAMD4BQ5PRF9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SAMD4BQ5PRF9 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SAMD4BQ5PRF9 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SAMD4BQ5PRF9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SAMD4BQ5PRF9 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SAMD4BQ5PRF9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SAMD4BQ5PRF9 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SAMD4BQ5PRF9 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SAMD4BQ5PRF9 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SAMD4BQ5PRF9 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SAMD4BQ5PRF9 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SAMD4BQ5PRF9 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SAMD4BQ5PRF9 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SAMD4BQ5PRF9 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SAMD4BQ5PRF9 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SAMD4BQ5PRF9 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SAMD4BQ5PRF9 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SAMD4BQ5PRF9 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SAMD4BQ5PRF9 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SAMD4BQ5PRF9 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SAMD4BQ5PRF9 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SAMD4BQ5PRF9 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SAMD4BQ5PRF9 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SAMD4BQ5PRF9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SAMD4BQ5PRF9 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SAMD4BQ5PRF9 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SAMD4BQ5PRF9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SAMD4BQ5PRF9 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SAMD4BQ5PRF9 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SAMD4BQ5PRF9 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SAMD4BQ5PRF9 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SAMD4BQ5PRF9 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SAMD4BQ5PRF9 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SAMD4BQ5PRF9 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SAMD4BQ5PRF9 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SAMD4BQ5PRF9 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SAMD4BQ5PRF9 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SAMD4BQ5PRF9 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SAMD4BQ5PRF9 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SAMD4BQ5PRF9 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SAMD4BQ5PRF9 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SAMD4BQ5PRF9 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SAMD4BQ5PRF9 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SAMD4BQ5PRF9 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SAMD4BQ5PRF9 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SAMD4BQ5PRF9 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SAMD4BQ5PRF9 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SAMD4BQ5PRF9 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SAMD4BQ5PRF9 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SAMD4BQ5PRF9 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SAMD4BQ5PRF9 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SAMD4BQ5PRF9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SAMD4BQ5PRF9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SAMD4BQ5PRF9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SAMD4BQ5PRF9 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SAMD4BQ5PRF9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SAMD4BQ5PRF9 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SAMD4BQ5PRF9 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SAMD4BQ5PRF9 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SAMD4BQ5PRF9 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SAMD4BQ5PRF9 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SAMD4BQ5PRF9 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SAMD4BQ5PRF9 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SAMD4BQ5PRF9 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SAMD4BQ5PRF9 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms