Protein–RNA interactions for Protein: Q5BN46

C9orf116, UPF0691 protein C9orf116, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf116Q5BN46 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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C9orf116Q5BN46 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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C9orf116Q5BN46 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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C9orf116Q5BN46 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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C9orf116Q5BN46 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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C9orf116Q5BN46 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
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C9orf116Q5BN46 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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C9orf116Q5BN46 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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C9orf116Q5BN46 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf116Q5BN46 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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C9orf116Q5BN46 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf116Q5BN46 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf116Q5BN46 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf116Q5BN46 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf116Q5BN46 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf116Q5BN46 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf116Q5BN46 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf116Q5BN46 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf116Q5BN46 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf116Q5BN46 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf116Q5BN46 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf116Q5BN46 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf116Q5BN46 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf116Q5BN46 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf116Q5BN46 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf116Q5BN46 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf116Q5BN46 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C9orf116Q5BN46 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C9orf116Q5BN46 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
C9orf116Q5BN46 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C9orf116Q5BN46 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
C9orf116Q5BN46 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C9orf116Q5BN46 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C9orf116Q5BN46 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C9orf116Q5BN46 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
C9orf116Q5BN46 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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