Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
TDRD12Q587J7 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms