Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NBPF1Q3BBV0 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NBPF1Q3BBV0 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NBPF1Q3BBV0 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NBPF1Q3BBV0 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NBPF1Q3BBV0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NBPF1Q3BBV0 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NBPF1Q3BBV0 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NBPF1Q3BBV0 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NBPF1Q3BBV0 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NBPF1Q3BBV0 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NBPF1Q3BBV0 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NBPF1Q3BBV0 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NBPF1Q3BBV0 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NBPF1Q3BBV0 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NBPF1Q3BBV0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NBPF1Q3BBV0 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NBPF1Q3BBV0 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NBPF1Q3BBV0 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NBPF1Q3BBV0 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NBPF1Q3BBV0 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NBPF1Q3BBV0 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NBPF1Q3BBV0 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NBPF1Q3BBV0 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NBPF1Q3BBV0 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NBPF1Q3BBV0 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NBPF1Q3BBV0 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NBPF1Q3BBV0 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NBPF1Q3BBV0 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NBPF1Q3BBV0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NBPF1Q3BBV0 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NBPF1Q3BBV0 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NBPF1Q3BBV0 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NBPF1Q3BBV0 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
NBPF1Q3BBV0 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NBPF1Q3BBV0 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NBPF1Q3BBV0 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NBPF1Q3BBV0 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NBPF1Q3BBV0 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NBPF1Q3BBV0 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NBPF1Q3BBV0 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NBPF1Q3BBV0 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NBPF1Q3BBV0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NBPF1Q3BBV0 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NBPF1Q3BBV0 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
NBPF1Q3BBV0 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NBPF1Q3BBV0 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NBPF1Q3BBV0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NBPF1Q3BBV0 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NBPF1Q3BBV0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NBPF1Q3BBV0 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NBPF1Q3BBV0 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NBPF1Q3BBV0 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NBPF1Q3BBV0 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NBPF1Q3BBV0 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NBPF1Q3BBV0 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NBPF1Q3BBV0 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NBPF1Q3BBV0 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NBPF1Q3BBV0 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NBPF1Q3BBV0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NBPF1Q3BBV0 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NBPF1Q3BBV0 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NBPF1Q3BBV0 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NBPF1Q3BBV0 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NBPF1Q3BBV0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NBPF1Q3BBV0 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NBPF1Q3BBV0 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NBPF1Q3BBV0 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NBPF1Q3BBV0 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NBPF1Q3BBV0 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NBPF1Q3BBV0 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NBPF1Q3BBV0 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NBPF1Q3BBV0 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NBPF1Q3BBV0 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NBPF1Q3BBV0 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NBPF1Q3BBV0 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NBPF1Q3BBV0 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NBPF1Q3BBV0 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NBPF1Q3BBV0 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NBPF1Q3BBV0 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NBPF1Q3BBV0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NBPF1Q3BBV0 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NBPF1Q3BBV0 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NBPF1Q3BBV0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NBPF1Q3BBV0 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NBPF1Q3BBV0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NBPF1Q3BBV0 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NBPF1Q3BBV0 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NBPF1Q3BBV0 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NBPF1Q3BBV0 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NBPF1Q3BBV0 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NBPF1Q3BBV0 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NBPF1Q3BBV0 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NBPF1Q3BBV0 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NBPF1Q3BBV0 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
NBPF1Q3BBV0 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
NBPF1Q3BBV0 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
NBPF1Q3BBV0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
NBPF1Q3BBV0 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NBPF1Q3BBV0 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms