Protein–RNA interactions for Protein: Q2NL82

TSR1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR1Q2NL82 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSR1Q2NL82 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSR1Q2NL82 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSR1Q2NL82 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TSR1Q2NL82 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSR1Q2NL82 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSR1Q2NL82 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSR1Q2NL82 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TSR1Q2NL82 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TSR1Q2NL82 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TSR1Q2NL82 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TSR1Q2NL82 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TSR1Q2NL82 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TSR1Q2NL82 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TSR1Q2NL82 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSR1Q2NL82 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSR1Q2NL82 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSR1Q2NL82 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSR1Q2NL82 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSR1Q2NL82 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSR1Q2NL82 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSR1Q2NL82 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSR1Q2NL82 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSR1Q2NL82 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSR1Q2NL82 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSR1Q2NL82 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSR1Q2NL82 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSR1Q2NL82 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSR1Q2NL82 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSR1Q2NL82 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSR1Q2NL82 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSR1Q2NL82 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSR1Q2NL82 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSR1Q2NL82 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSR1Q2NL82 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSR1Q2NL82 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSR1Q2NL82 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSR1Q2NL82 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSR1Q2NL82 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSR1Q2NL82 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSR1Q2NL82 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSR1Q2NL82 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSR1Q2NL82 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSR1Q2NL82 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSR1Q2NL82 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSR1Q2NL82 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSR1Q2NL82 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSR1Q2NL82 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSR1Q2NL82 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSR1Q2NL82 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSR1Q2NL82 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSR1Q2NL82 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSR1Q2NL82 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSR1Q2NL82 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSR1Q2NL82 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSR1Q2NL82 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSR1Q2NL82 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSR1Q2NL82 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TSR1Q2NL82 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSR1Q2NL82 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSR1Q2NL82 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSR1Q2NL82 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSR1Q2NL82 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSR1Q2NL82 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSR1Q2NL82 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSR1Q2NL82 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSR1Q2NL82 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSR1Q2NL82 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSR1Q2NL82 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSR1Q2NL82 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSR1Q2NL82 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSR1Q2NL82 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSR1Q2NL82 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSR1Q2NL82 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSR1Q2NL82 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSR1Q2NL82 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSR1Q2NL82 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSR1Q2NL82 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSR1Q2NL82 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSR1Q2NL82 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TSR1Q2NL82 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSR1Q2NL82 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSR1Q2NL82 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSR1Q2NL82 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSR1Q2NL82 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSR1Q2NL82 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSR1Q2NL82 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSR1Q2NL82 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSR1Q2NL82 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSR1Q2NL82 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSR1Q2NL82 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSR1Q2NL82 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSR1Q2NL82 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSR1Q2NL82 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSR1Q2NL82 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSR1Q2NL82 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSR1Q2NL82 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TSR1Q2NL82 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSR1Q2NL82 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSR1Q2NL82 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms