Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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