Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCK2Q16822 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PCK2Q16822 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PCK2Q16822 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCK2Q16822 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCK2Q16822 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCK2Q16822 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCK2Q16822 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCK2Q16822 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PCK2Q16822 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCK2Q16822 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCK2Q16822 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms