Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTN1Q16799 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTN1Q16799 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RTN1Q16799 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTN1Q16799 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTN1Q16799 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTN1Q16799 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTN1Q16799 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTN1Q16799 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTN1Q16799 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTN1Q16799 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTN1Q16799 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTN1Q16799 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTN1Q16799 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTN1Q16799 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTN1Q16799 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTN1Q16799 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTN1Q16799 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTN1Q16799 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTN1Q16799 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTN1Q16799 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTN1Q16799 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTN1Q16799 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTN1Q16799 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTN1Q16799 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTN1Q16799 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTN1Q16799 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTN1Q16799 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTN1Q16799 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTN1Q16799 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTN1Q16799 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTN1Q16799 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTN1Q16799 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTN1Q16799 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTN1Q16799 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTN1Q16799 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RTN1Q16799 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTN1Q16799 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTN1Q16799 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTN1Q16799 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTN1Q16799 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTN1Q16799 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTN1Q16799 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTN1Q16799 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTN1Q16799 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTN1Q16799 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTN1Q16799 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTN1Q16799 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTN1Q16799 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTN1Q16799 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTN1Q16799 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTN1Q16799 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTN1Q16799 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTN1Q16799 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTN1Q16799 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTN1Q16799 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RTN1Q16799 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTN1Q16799 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTN1Q16799 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTN1Q16799 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTN1Q16799 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTN1Q16799 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTN1Q16799 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTN1Q16799 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTN1Q16799 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTN1Q16799 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTN1Q16799 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTN1Q16799 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RTN1Q16799 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTN1Q16799 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTN1Q16799 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTN1Q16799 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTN1Q16799 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTN1Q16799 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTN1Q16799 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTN1Q16799 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTN1Q16799 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RTN1Q16799 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RTN1Q16799 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RTN1Q16799 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RTN1Q16799 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RTN1Q16799 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RTN1Q16799 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RTN1Q16799 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RTN1Q16799 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RTN1Q16799 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RTN1Q16799 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RTN1Q16799 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RTN1Q16799 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RTN1Q16799 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RTN1Q16799 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RTN1Q16799 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RTN1Q16799 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RTN1Q16799 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RTN1Q16799 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RTN1Q16799 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RTN1Q16799 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RTN1Q16799 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RTN1Q16799 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RTN1Q16799 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
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