Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDK4Q16654 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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