Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ACKR1Q16570 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
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