Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NTRK3Q16288 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NTRK3Q16288 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NTRK3Q16288 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NTRK3Q16288 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NTRK3Q16288 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NTRK3Q16288 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NTRK3Q16288 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NTRK3Q16288 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NTRK3Q16288 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NTRK3Q16288 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NTRK3Q16288 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NTRK3Q16288 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NTRK3Q16288 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NTRK3Q16288 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NTRK3Q16288 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NTRK3Q16288 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NTRK3Q16288 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NTRK3Q16288 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NTRK3Q16288 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NTRK3Q16288 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NTRK3Q16288 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NTRK3Q16288 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NTRK3Q16288 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NTRK3Q16288 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NTRK3Q16288 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NTRK3Q16288 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NTRK3Q16288 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NTRK3Q16288 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NTRK3Q16288 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NTRK3Q16288 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NTRK3Q16288 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NTRK3Q16288 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NTRK3Q16288 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NTRK3Q16288 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NTRK3Q16288 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NTRK3Q16288 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NTRK3Q16288 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NTRK3Q16288 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NTRK3Q16288 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NTRK3Q16288 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NTRK3Q16288 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NTRK3Q16288 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NTRK3Q16288 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NTRK3Q16288 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NTRK3Q16288 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NTRK3Q16288 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NTRK3Q16288 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NTRK3Q16288 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NTRK3Q16288 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NTRK3Q16288 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NTRK3Q16288 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NTRK3Q16288 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NTRK3Q16288 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NTRK3Q16288 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NTRK3Q16288 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NTRK3Q16288 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NTRK3Q16288 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NTRK3Q16288 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NTRK3Q16288 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NTRK3Q16288 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NTRK3Q16288 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NTRK3Q16288 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NTRK3Q16288 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NTRK3Q16288 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NTRK3Q16288 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NTRK3Q16288 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NTRK3Q16288 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NTRK3Q16288 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NTRK3Q16288 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NTRK3Q16288 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NTRK3Q16288 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NTRK3Q16288 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NTRK3Q16288 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NTRK3Q16288 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NTRK3Q16288 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NTRK3Q16288 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NTRK3Q16288 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NTRK3Q16288 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NTRK3Q16288 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NTRK3Q16288 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NTRK3Q16288 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NTRK3Q16288 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NTRK3Q16288 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NTRK3Q16288 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NTRK3Q16288 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NTRK3Q16288 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NTRK3Q16288 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NTRK3Q16288 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NTRK3Q16288 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NTRK3Q16288 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NTRK3Q16288 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NTRK3Q16288 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NTRK3Q16288 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NTRK3Q16288 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NTRK3Q16288 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NTRK3Q16288 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NTRK3Q16288 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NTRK3Q16288 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NTRK3Q16288 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
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