Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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