Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SKIV2LQ15477 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SKIV2LQ15477 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SKIV2LQ15477 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SKIV2LQ15477 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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