Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC23BQ15437 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC23BQ15437 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC23BQ15437 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC23BQ15437 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC23BQ15437 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC23BQ15437 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC23BQ15437 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC23BQ15437 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC23BQ15437 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC23BQ15437 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC23BQ15437 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEC23BQ15437 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEC23BQ15437 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEC23BQ15437 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEC23BQ15437 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEC23BQ15437 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEC23BQ15437 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEC23BQ15437 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEC23BQ15437 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEC23BQ15437 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEC23BQ15437 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEC23BQ15437 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEC23BQ15437 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SEC23BQ15437 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEC23BQ15437 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEC23BQ15437 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEC23BQ15437 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEC23BQ15437 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEC23BQ15437 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEC23BQ15437 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEC23BQ15437 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEC23BQ15437 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEC23BQ15437 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEC23BQ15437 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEC23BQ15437 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SEC23BQ15437 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEC23BQ15437 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEC23BQ15437 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SEC23BQ15437 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEC23BQ15437 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEC23BQ15437 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEC23BQ15437 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEC23BQ15437 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEC23BQ15437 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEC23BQ15437 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEC23BQ15437 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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SEC23BQ15437 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEC23BQ15437 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEC23BQ15437 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEC23BQ15437 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEC23BQ15437 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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SEC23BQ15437 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SEC23BQ15437 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
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SEC23BQ15437 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEC23BQ15437 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEC23BQ15437 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEC23BQ15437 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEC23BQ15437 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEC23BQ15437 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
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SEC23BQ15437 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
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SEC23BQ15437 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEC23BQ15437 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEC23BQ15437 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEC23BQ15437 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEC23BQ15437 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEC23BQ15437 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEC23BQ15437 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEC23BQ15437 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SEC23BQ15437 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEC23BQ15437 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEC23BQ15437 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEC23BQ15437 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEC23BQ15437 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEC23BQ15437 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEC23BQ15437 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEC23BQ15437 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEC23BQ15437 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEC23BQ15437 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEC23BQ15437 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEC23BQ15437 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEC23BQ15437 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC23BQ15437 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC23BQ15437 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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