Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HERC3Q15034 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
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