Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.195e-8■■■■■ 39.3
EFTUD2Q15029 ZC3H14-211ENST00000555755 2529 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.725e-8■■■■■ 39.3
EFTUD2Q15029 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.395e-8■■■■■ 39.3
EFTUD2Q15029 ZC3H14-205ENST00000393514 2195 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.535e-8■■■■■ 39.3
EFTUD2Q15029 RAD54L-204ENST00000463715 718 ntTSL 515.58■□□□□ 0.085e-7■■■■■ 39.3
EFTUD2Q15029 RAD54L-212ENST00000493985 810 ntTSL 415.04■□□□□ -05e-7■■■■■ 39.3
EFTUD2Q15029 RAD54L-205ENST00000469835 648 ntTSL 39.73□□□□□ -0.855e-7■■■■■ 39.3
EFTUD2Q15029 RAD54L-211ENST00000493032 627 ntTSL 37.88□□□□□ -1.155e-7■■■■■ 39.3
EFTUD2Q15029 RAD54L-209ENST00000487700 472 ntTSL 36.79□□□□□ -1.326e-7■■■■■ 39.3
EFTUD2Q15029 TMEM68-215ENST00000523180 510 ntTSL 29.85□□□□□ -0.832e-11■■■■■ 39.3
EFTUD2Q15029 TMEM68-201ENST00000334667 2401 ntTSL 2 BASIC8.82□□□□□ -12e-11■■■■■ 39.3
EFTUD2Q15029 TMEM68-216ENST00000523423 710 ntTSL 57.12□□□□□ -1.272e-11■■■■■ 39.3
EFTUD2Q15029 TMEM68-211ENST00000522090 1000 ntTSL 36.74□□□□□ -1.332e-11■■■■■ 39.3
EFTUD2Q15029 TMEM68-213ENST00000522576 826 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.472e-11■■■■■ 39.3
EFTUD2Q15029 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.52e-11■■■■■ 39.3
EFTUD2Q15029 TMEM68-205ENST00000519780 707 ntTSL 55.62□□□□□ -1.512e-11■■■■■ 39.3
EFTUD2Q15029 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.592e-11■■■■■ 39.3
EFTUD2Q15029 TMEM68-214ENST00000523073 536 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.752e-11■■■■■ 39.3
EFTUD2Q15029 TMEM68-206ENST00000519784 1009 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.772e-11■■■■■ 39.3
EFTUD2Q15029 AC005726.2-201ENST00000481916 2091 ntTSL 1 (best)22.07■■□□□ 1.127e-7■■■■■ 39.3
EFTUD2Q15029 UBE2D3-231ENST00000513098 702 ntTSL 311.71□□□□□ -0.535e-8■■■■■ 39.3
EFTUD2Q15029 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.424e-7■■■■■ 39.3
EFTUD2Q15029 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.214e-7■■■■■ 39.3
EFTUD2Q15029 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.174e-7■■■■■ 39.3
EFTUD2Q15029 RUVBL2-209ENST00000596837 682 ntTSL 220.98■□□□□ 0.956e-10■■■■■ 39.3
EFTUD2Q15029 RUVBL2-207ENST00000595811 572 ntTSL 520.78■□□□□ 0.926e-10■■■■■ 39.3
EFTUD2Q15029 RUVBL2-202ENST00000593570 813 ntTSL 519.8■□□□□ 0.766e-10■■■■■ 39.3
EFTUD2Q15029 RUVBL2-203ENST00000594017 959 ntTSL 219.63■□□□□ 0.736e-10■■■■■ 39.3
EFTUD2Q15029 RUVBL2-210ENST00000598768 497 ntTSL 59.39□□□□□ -0.916e-10■■■■■ 39.3
EFTUD2Q15029 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.711e-6■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 TERT-203ENST00000460137 2992 ntTSL 1 (best)19.65■□□□□ 0.741e-7■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.692e-6■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 RPL3-207ENST00000459859 447 ntTSL 319.35■□□□□ 0.691e-10■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 KRI1-202ENST00000432197 885 ntTSL 518.94■□□□□ 0.627e-8■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 FDXR-207ENST00000577932 572 ntTSL 218.85■□□□□ 0.611e-6■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 CBARP-203ENST00000589260 929 ntTSL 318.84■□□□□ 0.613e-7■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 CBARP-201ENST00000215376 834 ntTSL 318.41■□□□□ 0.543e-7■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 AP2A1-205ENST00000597774 2196 ntTSL 518.07■□□□□ 0.483e-7■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.441e-7■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 TFDP1-204ENST00000464794 447 ntTSL 1 (best)17.62■□□□□ 0.412e-6■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.371e-10■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 RPL3-218ENST00000498462 669 ntTSL 317.33■□□□□ 0.364e-11■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 TERT-204ENST00000484238 2422 ntTSL 517.33■□□□□ 0.361e-7■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.361e-10■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.361e-6■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 KRI1-210ENST00000543682 571 ntTSL 317.25■□□□□ 0.357e-8■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 SUGP1-211ENST00000590439 764 ntTSL 517.25■□□□□ 0.352e-7■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 TUBB3-211ENST00000556536 925 ntTSL 317.21■□□□□ 0.351e-10■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.311e-10■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 TUBB3-209ENST00000555609 1855 ntTSL 316.87■□□□□ 0.291e-10■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 TUBB3-212ENST00000556565 566 ntTSL 416.81■□□□□ 0.281e-10■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.281e-6■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 KRI1-208ENST00000537964 565 ntTSL 416.7■□□□□ 0.267e-8■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 SEH1L-203ENST00000585730 582 ntTSL 216.68■□□□□ 0.261e-10■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 MBD1-221ENST00000589867 673 ntTSL 316.59■□□□□ 0.253e-7■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 KRI1-213ENST00000546063 740 ntTSL 416.46■□□□□ 0.237e-8■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.191e-10■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.171e-10■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 PKDCC-208ENST00000490302 1447 ntTSL 216.08■□□□□ 0.161e-10■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 POLM-216ENST00000492605 1649 ntTSL 1 (best)16.08■□□□□ 0.163e-7■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 TMEM14B-203ENST00000460341 565 ntTSL 416.06■□□□□ 0.165e-6■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 SEH1L-206ENST00000589446 655 ntTSL 516.04■□□□□ 0.161e-10■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 SUGP1-202ENST00000535070 1094 ntTSL 215.93■□□□□ 0.142e-7■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 PKDCC-206ENST00000480099 787 ntTSL 515.9■□□□□ 0.141e-10■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 POLM-207ENST00000434229 1174 ntTSL 1 (best)15.87■□□□□ 0.133e-7■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.11e-10■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 PKDCC-203ENST00000470578 765 ntTSL 315.62■□□□□ 0.091e-10■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 POLM-214ENST00000492312 1149 ntTSL 1 (best)15.45■□□□□ 0.063e-7■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.061e-7■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 TMEM14B-214ENST00000480194 455 ntTSL 515.31■□□□□ 0.045e-6■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 SUGP1-204ENST00000585763 826 ntTSL 515.27■□□□□ 0.042e-7■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 ATG5-209ENST00000636335 1219 ntTSL 515.26■□□□□ 0.031e-10■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.031e-10■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 TUBB3-214ENST00000557490 806 ntTSL 515.18■□□□□ 0.021e-10■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.023e-7■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.023e-7■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 POLM-208ENST00000435068 2404 ntTSL 215.12■□□□□ 0.013e-7■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 FXYD2-203ENST00000317594 1567 ntTSL 1 (best)15.07■□□□□ 02e-6■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.011e-10■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 TUBB3-213ENST00000557262 888 ntTSL 1 (best)14.8□□□□□ -0.041e-10■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 AKT1-207ENST00000554192 922 ntTSL 214.74□□□□□ -0.052e-6■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 POLM-218ENST00000497300 575 ntTSL 414.71□□□□□ -0.053e-7■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.061e-10■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.075e-6■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 TMEM14B-219ENST00000492297 559 ntTSL 214.64□□□□□ -0.075e-6■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.084e-21■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.095e-6■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.095e-6■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.095e-6■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.13e-7■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 NAPRT-205ENST00000460623 694 ntTSL 314.4□□□□□ -0.11e-10■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.111e-10■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 TMEM14B-206ENST00000463448 1589 ntTSL 1 (best)14.34□□□□□ -0.115e-6■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 ATG5-202ENST00000360666 2712 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.131e-10■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.145e-6■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 RGS3-209ENST00000460000 536 ntTSL 414.06□□□□□ -0.161e-10■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 POLM-215ENST00000492321 962 ntTSL 214.06□□□□□ -0.163e-7■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 POLM-206ENST00000430942 2561 ntTSL 213.99□□□□□ -0.173e-7■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 TMEM14B-209ENST00000473166 752 ntTSL 313.89□□□□□ -0.195e-6■■■■■ 39.2
EFTUD2Q15029 HCN3-201ENST00000368358 3718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.21e-10■■■■■ 39.2
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