Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CNGB1Q14028 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CNGB1Q14028 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CNGB1Q14028 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CNGB1Q14028 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CNGB1Q14028 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CNGB1Q14028 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CNGB1Q14028 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CNGB1Q14028 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CNGB1Q14028 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CNGB1Q14028 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CNGB1Q14028 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CNGB1Q14028 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CNGB1Q14028 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CNGB1Q14028 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CNGB1Q14028 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CNGB1Q14028 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CNGB1Q14028 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CNGB1Q14028 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CNGB1Q14028 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CNGB1Q14028 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CNGB1Q14028 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CNGB1Q14028 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CNGB1Q14028 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CNGB1Q14028 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CNGB1Q14028 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CNGB1Q14028 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CNGB1Q14028 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CNGB1Q14028 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CNGB1Q14028 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CNGB1Q14028 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CNGB1Q14028 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CNGB1Q14028 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CNGB1Q14028 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CNGB1Q14028 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CNGB1Q14028 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CNGB1Q14028 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CNGB1Q14028 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CNGB1Q14028 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CNGB1Q14028 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CNGB1Q14028 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CNGB1Q14028 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CNGB1Q14028 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CNGB1Q14028 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CNGB1Q14028 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CNGB1Q14028 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CNGB1Q14028 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
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CNGB1Q14028 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CNGB1Q14028 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CNGB1Q14028 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CNGB1Q14028 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
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CNGB1Q14028 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CNGB1Q14028 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CNGB1Q14028 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
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CNGB1Q14028 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
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CNGB1Q14028 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
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CNGB1Q14028 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
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CNGB1Q14028 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
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CNGB1Q14028 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CNGB1Q14028 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CNGB1Q14028 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CNGB1Q14028 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CNGB1Q14028 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CNGB1Q14028 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CNGB1Q14028 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CNGB1Q14028 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CNGB1Q14028 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CNGB1Q14028 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CNGB1Q14028 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CNGB1Q14028 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CNGB1Q14028 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CNGB1Q14028 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CNGB1Q14028 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CNGB1Q14028 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CNGB1Q14028 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CNGB1Q14028 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CNGB1Q14028 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CNGB1Q14028 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CNGB1Q14028 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CNGB1Q14028 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CNGB1Q14028 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CNGB1Q14028 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CNGB1Q14028 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CNGB1Q14028 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CNGB1Q14028 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CNGB1Q14028 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CNGB1Q14028 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CNGB1Q14028 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CNGB1Q14028 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CNGB1Q14028 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
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