Protein–RNA interactions for Protein: Q14011

CIRBP, Cold-inducible RNA-binding protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBPQ14011 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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