Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
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