Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP1A4Q13733 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms