Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NEUROD1Q13562 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NEUROD1Q13562 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NEUROD1Q13562 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NEUROD1Q13562 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NEUROD1Q13562 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NEUROD1Q13562 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NEUROD1Q13562 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NEUROD1Q13562 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
NEUROD1Q13562 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
NEUROD1Q13562 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NEUROD1Q13562 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NEUROD1Q13562 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NEUROD1Q13562 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
NEUROD1Q13562 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
NEUROD1Q13562 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
NEUROD1Q13562 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
NEUROD1Q13562 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
NEUROD1Q13562 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
NEUROD1Q13562 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NEUROD1Q13562 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NEUROD1Q13562 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NEUROD1Q13562 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NEUROD1Q13562 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NEUROD1Q13562 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NEUROD1Q13562 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NEUROD1Q13562 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NEUROD1Q13562 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
NEUROD1Q13562 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NEUROD1Q13562 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NEUROD1Q13562 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NEUROD1Q13562 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NEUROD1Q13562 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NEUROD1Q13562 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NEUROD1Q13562 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NEUROD1Q13562 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NEUROD1Q13562 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NEUROD1Q13562 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NEUROD1Q13562 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
NEUROD1Q13562 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NEUROD1Q13562 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
NEUROD1Q13562 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NEUROD1Q13562 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NEUROD1Q13562 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NEUROD1Q13562 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NEUROD1Q13562 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NEUROD1Q13562 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NEUROD1Q13562 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NEUROD1Q13562 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NEUROD1Q13562 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NEUROD1Q13562 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NEUROD1Q13562 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NEUROD1Q13562 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NEUROD1Q13562 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NEUROD1Q13562 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NEUROD1Q13562 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NEUROD1Q13562 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NEUROD1Q13562 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NEUROD1Q13562 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NEUROD1Q13562 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NEUROD1Q13562 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NEUROD1Q13562 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NEUROD1Q13562 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NEUROD1Q13562 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NEUROD1Q13562 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NEUROD1Q13562 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NEUROD1Q13562 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NEUROD1Q13562 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NEUROD1Q13562 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NEUROD1Q13562 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NEUROD1Q13562 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NEUROD1Q13562 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NEUROD1Q13562 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NEUROD1Q13562 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
NEUROD1Q13562 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NEUROD1Q13562 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NEUROD1Q13562 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NEUROD1Q13562 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NEUROD1Q13562 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NEUROD1Q13562 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NEUROD1Q13562 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NEUROD1Q13562 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NEUROD1Q13562 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NEUROD1Q13562 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NEUROD1Q13562 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
NEUROD1Q13562 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NEUROD1Q13562 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
NEUROD1Q13562 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NEUROD1Q13562 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NEUROD1Q13562 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NEUROD1Q13562 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NEUROD1Q13562 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NEUROD1Q13562 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NEUROD1Q13562 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NEUROD1Q13562 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NEUROD1Q13562 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NEUROD1Q13562 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NEUROD1Q13562 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NEUROD1Q13562 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NEUROD1Q13562 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
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