Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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