Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
XRCC4Q13426 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
XRCC4Q13426 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
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