Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NME3Q13232 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NME3Q13232 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NME3Q13232 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NME3Q13232 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NME3Q13232 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NME3Q13232 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NME3Q13232 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NME3Q13232 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NME3Q13232 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NME3Q13232 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NME3Q13232 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NME3Q13232 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NME3Q13232 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NME3Q13232 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NME3Q13232 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NME3Q13232 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NME3Q13232 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NME3Q13232 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NME3Q13232 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NME3Q13232 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NME3Q13232 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NME3Q13232 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NME3Q13232 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NME3Q13232 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NME3Q13232 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NME3Q13232 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NME3Q13232 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NME3Q13232 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NME3Q13232 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21■□□□□ 0.95
NME3Q13232 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NME3Q13232 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NME3Q13232 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NME3Q13232 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NME3Q13232 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NME3Q13232 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NME3Q13232 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NME3Q13232 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NME3Q13232 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NME3Q13232 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NME3Q13232 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NME3Q13232 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
NME3Q13232 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NME3Q13232 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NME3Q13232 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NME3Q13232 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NME3Q13232 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NME3Q13232 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NME3Q13232 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NME3Q13232 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NME3Q13232 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NME3Q13232 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NME3Q13232 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NME3Q13232 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NME3Q13232 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NME3Q13232 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NME3Q13232 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NME3Q13232 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NME3Q13232 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NME3Q13232 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NME3Q13232 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NME3Q13232 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NME3Q13232 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NME3Q13232 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NME3Q13232 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NME3Q13232 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NME3Q13232 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NME3Q13232 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NME3Q13232 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NME3Q13232 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NME3Q13232 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NME3Q13232 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NME3Q13232 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NME3Q13232 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NME3Q13232 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NME3Q13232 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NME3Q13232 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NME3Q13232 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NME3Q13232 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NME3Q13232 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NME3Q13232 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NME3Q13232 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NME3Q13232 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NME3Q13232 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NME3Q13232 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NME3Q13232 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NME3Q13232 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NME3Q13232 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NME3Q13232 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NME3Q13232 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NME3Q13232 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NME3Q13232 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NME3Q13232 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NME3Q13232 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NME3Q13232 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NME3Q13232 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NME3Q13232 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NME3Q13232 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NME3Q13232 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NME3Q13232 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
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