Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

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Length 1,484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
GRIN2BQ13224 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
GRIN2BQ13224 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
GRIN2BQ13224 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
GRIN2BQ13224 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
GRIN2BQ13224 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
GRIN2BQ13224 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
GRIN2BQ13224 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
GRIN2BQ13224 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
GRIN2BQ13224 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
GRIN2BQ13224 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
GRIN2BQ13224 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
GRIN2BQ13224 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
GRIN2BQ13224 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
GRIN2BQ13224 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
GRIN2BQ13224 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
GRIN2BQ13224 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
GRIN2BQ13224 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
GRIN2BQ13224 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
GRIN2BQ13224 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
GRIN2BQ13224 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
GRIN2BQ13224 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
GRIN2BQ13224 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
GRIN2BQ13224 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
GRIN2BQ13224 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
GRIN2BQ13224 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC33.19■■■□□ 2.9
GRIN2BQ13224 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
GRIN2BQ13224 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
GRIN2BQ13224 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
GRIN2BQ13224 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
GRIN2BQ13224 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
GRIN2BQ13224 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC33.19■■■□□ 2.9
GRIN2BQ13224 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
GRIN2BQ13224 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
GRIN2BQ13224 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
GRIN2BQ13224 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
GRIN2BQ13224 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
GRIN2BQ13224 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
GRIN2BQ13224 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
GRIN2BQ13224 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
GRIN2BQ13224 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
GRIN2BQ13224 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
GRIN2BQ13224 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
GRIN2BQ13224 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
GRIN2BQ13224 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC33.18■■■□□ 2.9
GRIN2BQ13224 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
GRIN2BQ13224 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
GRIN2BQ13224 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
GRIN2BQ13224 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
GRIN2BQ13224 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
GRIN2BQ13224 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
GRIN2BQ13224 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
GRIN2BQ13224 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
GRIN2BQ13224 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
GRIN2BQ13224 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
GRIN2BQ13224 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
GRIN2BQ13224 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
GRIN2BQ13224 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
GRIN2BQ13224 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
GRIN2BQ13224 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
GRIN2BQ13224 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
GRIN2BQ13224 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
GRIN2BQ13224 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
GRIN2BQ13224 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
GRIN2BQ13224 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
GRIN2BQ13224 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
GRIN2BQ13224 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC33.16■■■□□ 2.9
GRIN2BQ13224 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
GRIN2BQ13224 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
GRIN2BQ13224 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
GRIN2BQ13224 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
GRIN2BQ13224 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
GRIN2BQ13224 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
GRIN2BQ13224 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC33.14■■■□□ 2.9
GRIN2BQ13224 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
GRIN2BQ13224 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC33.14■■■□□ 2.9
GRIN2BQ13224 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
GRIN2BQ13224 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
GRIN2BQ13224 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
GRIN2BQ13224 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
GRIN2BQ13224 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
GRIN2BQ13224 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
GRIN2BQ13224 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
GRIN2BQ13224 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
GRIN2BQ13224 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
GRIN2BQ13224 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
GRIN2BQ13224 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
GRIN2BQ13224 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
GRIN2BQ13224 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
GRIN2BQ13224 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
GRIN2BQ13224 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
GRIN2BQ13224 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
GRIN2BQ13224 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
GRIN2BQ13224 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC33.12■■■□□ 2.89
GRIN2BQ13224 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
GRIN2BQ13224 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
GRIN2BQ13224 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
GRIN2BQ13224 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC33.12■■■□□ 2.89
GRIN2BQ13224 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
GRIN2BQ13224 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
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