Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXF2Q12947 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXF2Q12947 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXF2Q12947 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXF2Q12947 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXF2Q12947 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXF2Q12947 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXF2Q12947 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXF2Q12947 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXF2Q12947 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXF2Q12947 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXF2Q12947 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXF2Q12947 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXF2Q12947 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXF2Q12947 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXF2Q12947 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXF2Q12947 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXF2Q12947 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXF2Q12947 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXF2Q12947 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXF2Q12947 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXF2Q12947 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXF2Q12947 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXF2Q12947 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXF2Q12947 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXF2Q12947 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXF2Q12947 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXF2Q12947 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
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