Protein–RNA interactions for Protein: Q12874

SF3A3, Splicing factor 3A subunit 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A3Q12874 FKBP11-213ENST00000553027 4957 nt15.33■□□□□ 0.054e-8■■■■■ 29.3
SF3A3Q12874 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.034e-7■■■■■ 29.3
SF3A3Q12874 GSE1-201ENST00000253458 7495 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.054e-7■■■■■ 29.3
SF3A3Q12874 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.254e-8■■■■■ 29.3
SF3A3Q12874 FKBP11-210ENST00000551694 2661 ntTSL 213.34□□□□□ -0.274e-8■■■■■ 29.3
SF3A3Q12874 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.374e-8■■■■■ 29.3
SF3A3Q12874 AC073610.2-201ENST00000537495 406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.454e-8■■■■■ 29.3
SF3A3Q12874 FKBP11-201ENST00000256680 725 ntTSL 311.12□□□□□ -0.634e-8■■■■■ 29.3
SF3A3Q12874 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.634e-8■■■■■ 29.3
SF3A3Q12874 FKBP11-206ENST00000547789 482 ntTSL 411.12□□□□□ -0.634e-8■■■■■ 29.3
SF3A3Q12874 AC073610.3-201ENST00000398092 939 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.014e-8■■■■■ 29.3
SF3A3Q12874 NFKBID-206ENST00000588497 829 ntTSL 517.39■□□□□ 0.371e-8■■■■■ 29.2
SF3A3Q12874 NFKBID-207ENST00000590094 751 ntTSL 315.5■□□□□ 0.071e-8■■■■■ 29.2
SF3A3Q12874 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.566e-7■■■■■ 29.2
SF3A3Q12874 HEMK1-204ENST00000443894 634 ntTSL 313.05□□□□□ -0.326e-7■■■■■ 29.2
SF3A3Q12874 HEMK1-207ENST00000482974 3265 ntTSL 210.9□□□□□ -0.666e-7■■■■■ 29.2
SF3A3Q12874 SUGP1-210ENST00000589144 2066 ntTSL 1 (best)17.62■□□□□ 0.412e-7■■■■■ 29.2
SF3A3Q12874 SUGP1-206ENST00000587119 2177 ntTSL 216.67■□□□□ 0.262e-7■■■■■ 29.2
SF3A3Q12874 SUGP1-209ENST00000588731 2282 ntTSL 1 (best)15.68■□□□□ 0.12e-7■■■■■ 29.2
SF3A3Q12874 SUGP1-204ENST00000585763 826 ntTSL 514.45□□□□□ -0.12e-7■■■■■ 29.2
SF3A3Q12874 SUGP1-201ENST00000247001 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.422e-7■■■■■ 29.2
SF3A3Q12874 MAU2-215ENST00000609060 707 ntTSL 511.63□□□□□ -0.552e-6■■■■■ 29.2
SF3A3Q12874 MAU2-204ENST00000585823 568 ntTSL 57.66□□□□□ -1.182e-6■■■■■ 29.2
SF3A3Q12874 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.289e-8■■■■■ 29.2
SF3A3Q12874 MAP2K2-210ENST00000601786 1778 ntTSL 219.49■□□□□ 0.719e-8■■■■■ 29.2
SF3A3Q12874 MAP2K2-208ENST00000599345 923 ntTSL 518.64■□□□□ 0.579e-8■■■■■ 29.2
SF3A3Q12874 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.569e-8■■■■■ 29.2
SF3A3Q12874 MAP2K2-203ENST00000593364 872 ntTSL 518.09■□□□□ 0.499e-8■■■■■ 29.2
SF3A3Q12874 POLR3A-203ENST00000473588 1022 ntTSL 513.97□□□□□ -0.179e-8■■■■■ 29.2
SF3A3Q12874 MAP2K2-211ENST00000602167 431 ntTSL 513.28□□□□□ -0.289e-8■■■■■ 29.2
SF3A3Q12874 MAP2K2-205ENST00000597008 866 ntTSL 29.89□□□□□ -0.839e-8■■■■■ 29.2
SF3A3Q12874 POLR3E-211ENST00000564750 2327 ntTSL 218.23■□□□□ 0.514e-7■■■■■ 29.2
SF3A3Q12874 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.21e-6■■■■■ 29.2
SF3A3Q12874 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.069e-7■■■■■ 29.2
SF3A3Q12874 MYBBP1A-202ENST00000381556 4104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.469e-7■■■■■ 29.2
SF3A3Q12874 MYBBP1A-207ENST00000573116 3795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)11.5□□□□□ -0.579e-7■■■■■ 29.2
SF3A3Q12874 CAPN10-214ENST00000483602 543 ntTSL 316.54■□□□□ 0.242e-6■■■■■ 29.2
SF3A3Q12874 CAPN10-215ENST00000493058 907 ntTSL 513.73□□□□□ -0.212e-6■■■■■ 29.2
SF3A3Q12874 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.261e-14■■■■■ 29.2
SF3A3Q12874 SERPINF1-211ENST00000576406 795 ntTSL 311.95□□□□□ -0.51e-14■■■■■ 29.2
SF3A3Q12874 SERPINF1-209ENST00000573763 729 ntTSL 38.57□□□□□ -1.041e-14■■■■■ 29.2
SF3A3Q12874 SERPINF1-207ENST00000572048 573 ntTSL 27.21□□□□□ -1.261e-14■■■■■ 29.2
SF3A3Q12874 AMBP-204ENST00000603230 1057 ntTSL 1 (best)13.88□□□□□ -0.192e-11■■■■■ 29.2
SF3A3Q12874 AMBP-203ENST00000540645 1356 ntTSL 211.88□□□□□ -0.512e-11■■■■■ 29.2
SF3A3Q12874 AMBP-202ENST00000466610 579 ntTSL 39.96□□□□□ -0.822e-11■■■■■ 29.2
SF3A3Q12874 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 11e-11■■■■■ 29.2
SF3A3Q12874 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.931e-11■■■■■ 29.2
SF3A3Q12874 GRINA-205ENST00000529301 1075 ntTSL 319.27■□□□□ 0.681e-11■■■■■ 29.2
SF3A3Q12874 GRINA-203ENST00000525513 796 ntTSL 515.14■□□□□ 0.011e-11■■■■■ 29.2
SF3A3Q12874 GRINA-210ENST00000534791 1050 ntTSL 59.21□□□□□ -0.941e-11■■■■■ 29.2
SF3A3Q12874 GRINA-208ENST00000533044 564 ntTSL 37.88□□□□□ -1.151e-11■■■■■ 29.2
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SF3A3Q12874 COL27A1-202ENST00000451716 2865 ntTSL 1 (best)12.76□□□□□ -0.371e-7■■■■■ 29.1
SF3A3Q12874 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.233e-7■■■■■ 29.1
SF3A3Q12874 SPPL2B-213ENST00000621568 1017 ntTSL 516.33■□□□□ 0.23e-7■■■■■ 29.1
SF3A3Q12874 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.073e-7■■■■■ 29.1
SF3A3Q12874 HSF1-203ENST00000528199 659 ntTSL 514.23□□□□□ -0.132e-7■■■■■ 29.1
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SF3A3Q12874 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.043e-7■■■■■ 29.1
SF3A3Q12874 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.023e-7■■■■■ 29.1
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SF3A3Q12874 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.373e-7■■■■■ 29.1
SF3A3Q12874 TRMT2A-220ENST00000494820 1098 ntTSL 512.85□□□□□ -0.353e-7■■■■■ 29.1
SF3A3Q12874 AFG3L1P-216ENST00000458301 2298 ntTSL 211.25□□□□□ -0.613e-6■■■■■ 29.1
SF3A3Q12874 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.561e-6■■■■■ 29.1
SF3A3Q12874 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.251e-6■■■■■ 29.1
SF3A3Q12874 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.211e-6■■■■■ 29.1
SF3A3Q12874 TRIP10-203ENST00000595305 2068 ntTSL 215.98■□□□□ 0.151e-6■■■■■ 29.1
SF3A3Q12874 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.111e-6■■■■■ 29.1
SF3A3Q12874 TRIP10-212ENST00000600677 2022 ntTSL 515.48■□□□□ 0.071e-6■■■■■ 29.1
SF3A3Q12874 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.029e-7■■■■■ 29
SF3A3Q12874 PKM-212ENST00000564440 3016 ntTSL 1 (best)9.79□□□□□ -0.849e-7■■■■■ 29
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SF3A3Q12874 ZNF444-208ENST00000588358 642 ntTSL 220.12■□□□□ 0.815e-8■■■■■ 29
SF3A3Q12874 ZNF444-203ENST00000587195 571 ntTSL 420.12■□□□□ 0.815e-8■■■■■ 29
SF3A3Q12874 ZNF444-207ENST00000588203 585 ntTSL 418.73■□□□□ 0.595e-8■■■■■ 29
SF3A3Q12874 ZNF444-205ENST00000587467 646 ntTSL 218.57■□□□□ 0.565e-8■■■■■ 29
SF3A3Q12874 ZNF444-212ENST00000593100 562 ntTSL 218.41■□□□□ 0.545e-8■■■■■ 29
SF3A3Q12874 ZNF444-209ENST00000591564 586 ntTSL 217.54■□□□□ 0.45e-8■■■■■ 29
SF3A3Q12874 SMARCA4-213ENST00000587988 552 ntTSL 210.07□□□□□ -0.82e-6■■■■■ 29
SF3A3Q12874 SMARCA4-209ENST00000586122 512 ntTSL 59.18□□□□□ -0.942e-6■■■■■ 29
SF3A3Q12874 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.594e-17■■■■■ 29
SF3A3Q12874 ACAT2-203ENST00000472052 1641 ntTSL 28.93□□□□□ -0.984e-17■■■■■ 29
SF3A3Q12874 NADSYN1-219ENST00000531236 3429 ntTSL 212.8□□□□□ -0.365e-10■■■■■ 29
SF3A3Q12874 NADSYN1-215ENST00000529840 820 ntTSL 511.4□□□□□ -0.585e-10■■■■■ 29
SF3A3Q12874 NADSYN1-210ENST00000527852 582 ntTSL 511.07□□□□□ -0.645e-10■■■■■ 29
SF3A3Q12874 NADSYN1-207ENST00000526039 769 ntTSL 511.04□□□□□ -0.645e-10■■■■■ 29
SF3A3Q12874 TCIRG1-216ENST00000534673 848 ntTSL 318.48■□□□□ 0.552e-7■■■■■ 29
SF3A3Q12874 TCIRG1-215ENST00000533947 956 ntTSL 518.38■□□□□ 0.532e-7■■■■■ 29
SF3A3Q12874 TCIRG1-209ENST00000529657 842 ntTSL 517.53■□□□□ 0.42e-7■■■■■ 29
SF3A3Q12874 TCIRG1-202ENST00000524598 940 ntTSL 515.17■□□□□ 0.022e-7■■■■■ 29
SF3A3Q12874 MAN2C1-234ENST00000566634 1540 ntTSL 516.17■□□□□ 0.182e-7■■■■■ 29
SF3A3Q12874 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.558e-8■■■■■ 29
SF3A3Q12874 APEH-201ENST00000296456 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.158e-8■■■■■ 29
SF3A3Q12874 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.774e-74■■■■■ 29
SF3A3Q12874 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.454e-74■■■■■ 29
SF3A3Q12874 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.434e-74■■■■■ 29
SF3A3Q12874 LRRC75A-AS1-224ENST00000581718 574 ntTSL 217.67■□□□□ 0.424e-74■■■■■ 29
SF3A3Q12874 LRRC75A-AS1-228ENST00000584141 564 ntTSL 216.18■□□□□ 0.184e-74■■■■■ 29
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