Protein–RNA interactions for Protein: Q12507

SFG1, Superficial pseudohyphal growth protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SFG1Q12507 YIL020C-AYIL020C-A 339 nt1.18□□□□□ -2.22
SFG1Q12507 MRPL50YNR022C 420 nt1.18□□□□□ -2.22
SFG1Q12507 PCF11YDR228C 1881 nt1.18□□□□□ -2.22
SFG1Q12507 SWI4YER111C 3282 nt1.18□□□□□ -2.22
SFG1Q12507 CDC36YDL165W 576 nt1.17□□□□□ -2.22
SFG1Q12507 YLR406C-AYLR406C-A 150 nt1.17□□□□□ -2.22
SFG1Q12507 HCH1YNL281W 462 nt1.17□□□□□ -2.22
SFG1Q12507 IML1YJR138W 4755 nt1.16□□□□□ -2.22
SFG1Q12507 NUT1YGL151W 3399 nt1.16□□□□□ -2.22
SFG1Q12507 NPC2YDL046W 522 nt1.16□□□□□ -2.22
SFG1Q12507 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt1.16□□□□□ -2.22
SFG1Q12507 snR14snR14 160 nt1.16□□□□□ -2.22
SFG1Q12507 NUP145YGL092W 3954 nt1.16□□□□□ -2.22
SFG1Q12507 SPO75YLL005C 2607 nt1.15□□□□□ -2.23
SFG1Q12507 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt1.15□□□□□ -2.23
SFG1Q12507 RPS24BYIL069C 408 nt1.15□□□□□ -2.23
SFG1Q12507 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt1.15□□□□□ -2.23
SFG1Q12507 SLI15YBR156C 2097 nt1.15□□□□□ -2.23
SFG1Q12507 FIG4YNL325C 2640 nt1.15□□□□□ -2.23
SFG1Q12507 MMS4YBR098W 2076 nt1.14□□□□□ -2.23
SFG1Q12507 YJR157WYJR157W 363 nt1.14□□□□□ -2.23
SFG1Q12507 VPS20YMR077C 666 nt1.14□□□□□ -2.23
SFG1Q12507 RRT1YBL048W 312 nt1.14□□□□□ -2.23
SFG1Q12507 YNL058CYNL058C 951 nt1.14□□□□□ -2.23
SFG1Q12507 RPL33BYOR234C 324 nt1.14□□□□□ -2.23
SFG1Q12507 APL3YBL037W 3078 nt1.14□□□□□ -2.23
SFG1Q12507 ENV11YGR071C 2583 nt1.13□□□□□ -2.23
SFG1Q12507 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt1.13□□□□□ -2.23
SFG1Q12507 YNL324WYNL324W 396 nt1.13□□□□□ -2.23
SFG1Q12507 YBR012CYBR012C 420 nt1.13□□□□□ -2.23
SFG1Q12507 LCD1YDR499W 2244 nt1.13□□□□□ -2.23
SFG1Q12507 TRM732YMR259C 4263 nt1.13□□□□□ -2.23
SFG1Q12507 MDS3YGL197W 4464 nt1.13□□□□□ -2.23
SFG1Q12507 YAP6YDR259C 1152 nt1.12□□□□□ -2.23
SFG1Q12507 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt1.12□□□□□ -2.23
SFG1Q12507 CLU1YMR012W 3834 nt1.11□□□□□ -2.23
SFG1Q12507 YHL041WYHL041W 450 nt1.11□□□□□ -2.23
SFG1Q12507 RPL26AYLR344W 384 nt1.11□□□□□ -2.23
SFG1Q12507 PRM3YPL192C 402 nt1.11□□□□□ -2.23
SFG1Q12507 snR51snR51 107 nt1.11□□□□□ -2.23
SFG1Q12507 SPT7YBR081C 3999 nt1.11□□□□□ -2.23
SFG1Q12507 BUD3YCL014W 4911 nt1.11□□□□□ -2.23
SFG1Q12507 YLR264C-AYLR264C-A 117 nt1.1□□□□□ -2.23
SFG1Q12507 YOL159CYOL159C 516 nt1.1□□□□□ -2.23
SFG1Q12507 YPL185WYPL185W 396 nt1.1□□□□□ -2.23
SFG1Q12507 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt1.1□□□□□ -2.23
SFG1Q12507 ISF1YMR081C 1017 nt1.09□□□□□ -2.23
SFG1Q12507 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt1.09□□□□□ -2.23
SFG1Q12507 NST1YNL091W 3723 nt1.09□□□□□ -2.24
SFG1Q12507 YJR003CYJR003C 1560 nt1.08□□□□□ -2.24
SFG1Q12507 YLR434CYLR434C 384 nt1.08□□□□□ -2.24
SFG1Q12507 PDE2YOR360C 1581 nt1.08□□□□□ -2.24
SFG1Q12507 STO1YMR125W 2586 nt1.07□□□□□ -2.24
SFG1Q12507 COG4YPR105C 2586 nt1.07□□□□□ -2.24
SFG1Q12507 RIM20YOR275C 1986 nt1.07□□□□□ -2.24
SFG1Q12507 SIP4YJL089W 2490 nt1.07□□□□□ -2.24
SFG1Q12507 AGA2YGL032C 264 nt1.07□□□□□ -2.24
SFG1Q12507 RPL34BYIL052C 366 nt1.07□□□□□ -2.24
SFG1Q12507 YOL160WYOL160W 342 nt1.07□□□□□ -2.24
SFG1Q12507 VAM6YDL077C 3150 nt1.07□□□□□ -2.24
SFG1Q12507 SMC1YFL008W 3678 nt1.07□□□□□ -2.24
SFG1Q12507 SET3YKR029C 2256 nt1.06□□□□□ -2.24
SFG1Q12507 INP2YMR163C 2118 nt1.06□□□□□ -2.24
SFG1Q12507 GPG1YGL121C 381 nt1.06□□□□□ -2.24
SFG1Q12507 STF2YGR008C 255 nt1.06□□□□□ -2.24
SFG1Q12507 YGR042WYGR042W 816 nt1.06□□□□□ -2.24
SFG1Q12507 YJL135WYJL135W 318 nt1.06□□□□□ -2.24
SFG1Q12507 YOR199WYOR199W 330 nt1.06□□□□□ -2.24
SFG1Q12507 YPL261CYPL261C 309 nt1.06□□□□□ -2.24
SFG1Q12507 YCS4YLR272C 3531 nt1.06□□□□□ -2.24
SFG1Q12507 EAF1YDR359C 2949 nt1.06□□□□□ -2.24
SFG1Q12507 APL1YJR005W 2103 nt1.06□□□□□ -2.24
SFG1Q12507 PKH2YOL100W 3246 nt1.06□□□□□ -2.24
SFG1Q12507 snR72snR72 98 nt1.05□□□□□ -2.24
SFG1Q12507 YJR029WYJR029W 5268 nt1.05□□□□□ -2.24
SFG1Q12507 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt1.05□□□□□ -2.24
SFG1Q12507 CUL3YGR003W 2235 nt1.04□□□□□ -2.24
SFG1Q12507 YER079WYER079W 633 nt1.04□□□□□ -2.24
SFG1Q12507 HUG1YML058W-A 207 nt1.04□□□□□ -2.24
SFG1Q12507 CDC39YCR093W 6327 nt1.03□□□□□ -2.24
SFG1Q12507 SWF1YDR126W 1011 nt1.03□□□□□ -2.24
SFG1Q12507 YLR222C-AYLR222C-A 231 nt1.03□□□□□ -2.24
SFG1Q12507 ALY2YJL084C 3141 nt1.03□□□□□ -2.24
SFG1Q12507 STB6YKL072W 2301 nt1.03□□□□□ -2.25
SFG1Q12507 TTI1YKL033W 3117 nt1.02□□□□□ -2.25
SFG1Q12507 YDL206WYDL206W 2289 nt1.02□□□□□ -2.25
SFG1Q12507 YIR044CYIR044C 186 nt1.02□□□□□ -2.25
SFG1Q12507 WAR1YML076C 2835 nt1.02□□□□□ -2.25
SFG1Q12507 YBR285WYBR285W 435 nt1.02□□□□□ -2.25
SFG1Q12507 PAC1YOR269W 1485 nt1□□□□□ -2.25
SFG1Q12507 RAD34YDR314C 2079 nt1□□□□□ -2.25
SFG1Q12507 YML007C-AYML007C-A 111 nt1□□□□□ -2.25
SFG1Q12507 YMR001C-AYMR001C-A 231 nt1□□□□□ -2.25
SFG1Q12507 YOR053WYOR053W 342 nt0.99□□□□□ -2.25
SFG1Q12507 SLD3YGL113W 2007 nt0.99□□□□□ -2.25
SFG1Q12507 BSC3YLR465C 309 nt0.98□□□□□ -2.25
SFG1Q12507 BEM2YER155C 6504 nt0.98□□□□□ -2.25
SFG1Q12507 ATG31YDR022C 591 nt0.97□□□□□ -2.25
SFG1Q12507 YHR138CYHR138C 345 nt0.97□□□□□ -2.25
SFG1Q12507 YOR029WYOR029W 336 nt0.97□□□□□ -2.25
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15.1 ms