Protein–RNA interactions for Protein: Q12347

HRT3, F-box protein HRT3, yeastyeast

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HRT3Q12347 YDL211CYDL211C 1119 nt1.57□□□□□ -2.16
HRT3Q12347 HCS1YKL017C 2052 nt1.57□□□□□ -2.16
HRT3Q12347 SYH1YPL105C 2550 nt1.56□□□□□ -2.16
HRT3Q12347 YGR250CYGR250C 2346 nt1.56□□□□□ -2.16
HRT3Q12347 YHL042WYHL042W 453 nt1.56□□□□□ -2.16
HRT3Q12347 RPB10YOR210W 213 nt1.56□□□□□ -2.16
HRT3Q12347 YPR063CYPR063C 423 nt1.56□□□□□ -2.16
HRT3Q12347 RFX1YLR176C 2436 nt1.56□□□□□ -2.16
HRT3Q12347 MUK1YPL070W 1839 nt1.55□□□□□ -2.16
HRT3Q12347 YCR102W-AYCR102W-A 198 nt1.55□□□□□ -2.16
HRT3Q12347 YGL188C-AYGL188C-A 141 nt1.55□□□□□ -2.16
HRT3Q12347 CYB5YNL111C 363 nt1.55□□□□□ -2.16
HRT3Q12347 PLC1YPL268W 2610 nt1.55□□□□□ -2.16
HRT3Q12347 PKH3YDR466W 2697 nt1.55□□□□□ -2.16
HRT3Q12347 INP2YMR163C 2118 nt1.54□□□□□ -2.16
HRT3Q12347 LYS14YDR034C 2373 nt1.54□□□□□ -2.16
HRT3Q12347 snR80snR80 171 nt1.54□□□□□ -2.16
HRT3Q12347 TRX1YLR043C 312 nt1.54□□□□□ -2.16
HRT3Q12347 CCH1YGR217W 6120 nt1.54□□□□□ -2.16
HRT3Q12347 COG8YML071C 1824 nt1.54□□□□□ -2.16
HRT3Q12347 NAM7YMR080C 2916 nt1.53□□□□□ -2.16
HRT3Q12347 IRR1YIL026C 3453 nt1.53□□□□□ -2.16
HRT3Q12347 MSH3YCR092C 3057 nt1.53□□□□□ -2.16
HRT3Q12347 snR72snR72 98 nt1.53□□□□□ -2.16
HRT3Q12347 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt1.53□□□□□ -2.16
HRT3Q12347 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt1.53□□□□□ -2.16
HRT3Q12347 PET309YLR067C 2898 nt1.53□□□□□ -2.17
HRT3Q12347 SLY1YDR189W 2001 nt1.52□□□□□ -2.17
HRT3Q12347 TFC8YPL007C 1767 nt1.52□□□□□ -2.17
HRT3Q12347 YCR087C-AYCR087C-A 462 nt1.52□□□□□ -2.17
HRT3Q12347 YGL041CYGL041C 204 nt1.52□□□□□ -2.17
HRT3Q12347 YGR265WYGR265W 411 nt1.52□□□□□ -2.17
HRT3Q12347 SDH2YLL041C 801 nt1.52□□□□□ -2.17
HRT3Q12347 YOR008C-AYOR008C-A 225 nt1.52□□□□□ -2.17
HRT3Q12347 ZRG17YNR039C 1818 nt1.52□□□□□ -2.17
HRT3Q12347 YLR422WYLR422W 5799 nt1.51□□□□□ -2.17
HRT3Q12347 SRP14YDL092W 441 nt1.51□□□□□ -2.17
HRT3Q12347 SSS1YDR086C 243 nt1.51□□□□□ -2.17
HRT3Q12347 SPG3YDR504C 384 nt1.51□□□□□ -2.17
HRT3Q12347 YBR174CYBR174C 315 nt1.51□□□□□ -2.17
HRT3Q12347 snR49snR49 165 nt1.51□□□□□ -2.17
HRT3Q12347 MDM20YOL076W 2391 nt1.51□□□□□ -2.17
HRT3Q12347 MMS22YLR320W 4365 nt1.51□□□□□ -2.17
HRT3Q12347 YBR064WYBR064W 429 nt1.5□□□□□ -2.17
HRT3Q12347 SCW11YGL028C 1629 nt1.5□□□□□ -2.17
HRT3Q12347 YLL032CYLL032C 2478 nt1.49□□□□□ -2.17
HRT3Q12347 ZIP1YDR285W 2628 nt1.49□□□□□ -2.17
HRT3Q12347 JLP2YMR132C 627 nt1.49□□□□□ -2.17
HRT3Q12347 PMD1YER132C 5262 nt1.48□□□□□ -2.17
HRT3Q12347 YJR039WYJR039W 3366 nt1.48□□□□□ -2.17
HRT3Q12347 YER088C-AYER088C-A 324 nt1.48□□□□□ -2.17
HRT3Q12347 SPT21YMR179W 2277 nt1.48□□□□□ -2.17
HRT3Q12347 LCD1YDR499W 2244 nt1.47□□□□□ -2.17
HRT3Q12347 MSH6YDR097C 3729 nt1.47□□□□□ -2.17
HRT3Q12347 VIK1YPL253C 1944 nt1.47□□□□□ -2.17
HRT3Q12347 INA22YIR024C 651 nt1.47□□□□□ -2.17
HRT3Q12347 YNL028WYNL028W 318 nt1.47□□□□□ -2.17
HRT3Q12347 CSE2YNR010W 450 nt1.47□□□□□ -2.17
HRT3Q12347 YOL155W-AYOL155W-A 135 nt1.47□□□□□ -2.17
HRT3Q12347 MAK10YEL053C 2202 nt1.47□□□□□ -2.17
HRT3Q12347 YGR109W-BYGR109W-B 4644 nt1.46□□□□□ -2.18
HRT3Q12347 MSC6YOR354C 2079 nt1.46□□□□□ -2.18
HRT3Q12347 CDC36YDL165W 576 nt1.46□□□□□ -2.18
HRT3Q12347 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.46□□□□□ -2.18
HRT3Q12347 ABF2YMR072W 552 nt1.46□□□□□ -2.18
HRT3Q12347 YGR130CYGR130C 2451 nt1.45□□□□□ -2.18
HRT3Q12347 HIR3YJR140C 4947 nt1.45□□□□□ -2.18
HRT3Q12347 snR55snR55 98 nt1.45□□□□□ -2.18
HRT3Q12347 PAU3YCR104W 375 nt1.45□□□□□ -2.18
HRT3Q12347 IRE1YHR079C 3348 nt1.45□□□□□ -2.18
HRT3Q12347 TUS1YLR425W 3924 nt1.45□□□□□ -2.18
HRT3Q12347 MPT5YGL178W 2580 nt1.45□□□□□ -2.18
HRT3Q12347 YOL160WYOL160W 342 nt1.44□□□□□ -2.18
HRT3Q12347 SAS3YBL052C 2496 nt1.44□□□□□ -2.18
HRT3Q12347 PET127YOR017W 2403 nt1.43□□□□□ -2.18
HRT3Q12347 YGL052WYGL052W 306 nt1.43□□□□□ -2.18
HRT3Q12347 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt1.43□□□□□ -2.18
HRT3Q12347 YOR015WYOR015W 360 nt1.43□□□□□ -2.18
HRT3Q12347 SPC98YNL126W 2541 nt1.43□□□□□ -2.18
HRT3Q12347 CTR9YOL145C 3234 nt1.43□□□□□ -2.18
HRT3Q12347 PIP2YOR363C 2991 nt1.43□□□□□ -2.18
HRT3Q12347 MSH5YDL154W 2706 nt1.43□□□□□ -2.18
HRT3Q12347 MON2YNL297C 4911 nt1.42□□□□□ -2.18
HRT3Q12347 ZIP2YGL249W 2115 nt1.42□□□□□ -2.18
HRT3Q12347 HMI1YOL095C 2121 nt1.42□□□□□ -2.18
HRT3Q12347 MLH3YPL164C 2148 nt1.42□□□□□ -2.18
HRT3Q12347 RPL31AYDL075W 342 nt1.42□□□□□ -2.18
HRT3Q12347 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt1.42□□□□□ -2.18
HRT3Q12347 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt1.42□□□□□ -2.18
HRT3Q12347 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt1.42□□□□□ -2.18
HRT3Q12347 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt1.42□□□□□ -2.18
HRT3Q12347 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt1.42□□□□□ -2.18
HRT3Q12347 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt1.42□□□□□ -2.18
HRT3Q12347 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt1.42□□□□□ -2.18
HRT3Q12347 tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 76 nt1.42□□□□□ -2.18
HRT3Q12347 BLI1YKL061W 342 nt1.42□□□□□ -2.18
HRT3Q12347 YLR120W-AYLR120W-A 102 nt1.42□□□□□ -2.18
HRT3Q12347 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt1.42□□□□□ -2.18
HRT3Q12347 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt1.42□□□□□ -2.18
HRT3Q12347 YCK3YER123W 1575 nt1.42□□□□□ -2.18
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 30.1 ms