Protein–RNA interactions for Protein: Q12215

WSC3, Cell wall integrity and stress response component 3, yeastyeast

Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
WSC3Q12215 RPO31YOR116C 4383 nt3.45□□□□□ -1.86
WSC3Q12215 RAD4YER162C 2265 nt3.45□□□□□ -1.86
WSC3Q12215 tQ(UUG)CtQ(UUG)C 72 nt3.45□□□□□ -1.86
WSC3Q12215 tQ(UUG)D1tQ(UUG)D1 72 nt3.45□□□□□ -1.86
WSC3Q12215 tQ(UUG)D2tQ(UUG)D2 72 nt3.45□□□□□ -1.86
WSC3Q12215 tQ(UUG)D3tQ(UUG)D3 72 nt3.45□□□□□ -1.86
WSC3Q12215 tQ(UUG)E1tQ(UUG)E1 72 nt3.45□□□□□ -1.86
WSC3Q12215 tQ(UUG)HtQ(UUG)H 72 nt3.45□□□□□ -1.86
WSC3Q12215 tQ(UUG)LtQ(UUG)L 72 nt3.45□□□□□ -1.86
WSC3Q12215 RAD2YGR258C 3096 nt3.45□□□□□ -1.86
WSC3Q12215 ATG2YNL242W 4779 nt3.45□□□□□ -1.86
WSC3Q12215 SMC1YFL008W 3678 nt3.45□□□□□ -1.86
WSC3Q12215 NOG1YPL093W 1944 nt3.44□□□□□ -1.86
WSC3Q12215 POL5YEL055C 3069 nt3.44□□□□□ -1.86
WSC3Q12215 YHR032C-AYHR032C-A 120 nt3.44□□□□□ -1.86
WSC3Q12215 RDN5-1RDN5-1 121 nt3.44□□□□□ -1.86
WSC3Q12215 RDN5-6RDN5-6 121 nt3.44□□□□□ -1.86
WSC3Q12215 MET6YER091C 2304 nt3.44□□□□□ -1.86
WSC3Q12215 SRO7YPR032W 3102 nt3.44□□□□□ -1.86
WSC3Q12215 YGR109W-BYGR109W-B 4644 nt3.43□□□□□ -1.86
WSC3Q12215 SYT1YPR095C 3681 nt3.43□□□□□ -1.86
WSC3Q12215 MGA2YIR033W 3342 nt3.43□□□□□ -1.86
WSC3Q12215 GAL11YOL051W 3246 nt3.43□□□□□ -1.86
WSC3Q12215 SFB2YNL049C 2631 nt3.42□□□□□ -1.86
WSC3Q12215 AI1Q0050 2505 nt3.42□□□□□ -1.86
WSC3Q12215 PSY2YNL201C 2577 nt3.42□□□□□ -1.86
WSC3Q12215 MYO5YMR109W 3660 nt3.42□□□□□ -1.86
WSC3Q12215 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt3.42□□□□□ -1.86
WSC3Q12215 ALA1YOR335C 2877 nt3.42□□□□□ -1.86
WSC3Q12215 SCP160YJL080C 3669 nt3.42□□□□□ -1.86
WSC3Q12215 WAR1YML076C 2835 nt3.42□□□□□ -1.86
WSC3Q12215 FLO9YAL063C 3969 nt3.41□□□□□ -1.86
WSC3Q12215 TAE2YPL009C 3117 nt3.41□□□□□ -1.86
WSC3Q12215 TIM9YEL020W-A 264 nt3.41□□□□□ -1.86
WSC3Q12215 VTC3YPL019C 2508 nt3.41□□□□□ -1.86
WSC3Q12215 MYO3YKL129C 3819 nt3.41□□□□□ -1.86
WSC3Q12215 LOS1YKL205W 3303 nt3.4□□□□□ -1.86
WSC3Q12215 YOL019W-AYOL019W-A 153 nt3.4□□□□□ -1.87
WSC3Q12215 NOP14YDL148C 2433 nt3.4□□□□□ -1.87
WSC3Q12215 YDL073WYDL073W 2955 nt3.39□□□□□ -1.87
WSC3Q12215 YGL063C-AYGL063C-A 150 nt3.39□□□□□ -1.87
WSC3Q12215 MGM1YOR211C 2646 nt3.38□□□□□ -1.87
WSC3Q12215 YMR317WYMR317W 3423 nt3.38□□□□□ -1.87
WSC3Q12215 IES6YEL044W 501 nt3.37□□□□□ -1.87
WSC3Q12215 YJR112W-AYJR112W-A 330 nt3.37□□□□□ -1.87
WSC3Q12215 KCS1YDR017C 3153 nt3.37□□□□□ -1.87
WSC3Q12215 GSC2YGR032W 5688 nt3.37□□□□□ -1.87
WSC3Q12215 YCF1YDR135C 4548 nt3.36□□□□□ -1.87
WSC3Q12215 SPO24YPR036W-A 204 nt3.36□□□□□ -1.87
WSC3Q12215 YLR278CYLR278C 4026 nt3.36□□□□□ -1.87
WSC3Q12215 TAF2YCR042C 4224 nt3.35□□□□□ -1.87
WSC3Q12215 RSM22YKL155C 1887 nt3.35□□□□□ -1.87
WSC3Q12215 GCV2YMR189W 3105 nt3.34□□□□□ -1.88
WSC3Q12215 AZF1YOR113W 2745 nt3.34□□□□□ -1.88
WSC3Q12215 RPL41AYDL184C 78 nt3.33□□□□□ -1.88
WSC3Q12215 DCP2YNL118C 2913 nt3.33□□□□□ -1.88
WSC3Q12215 FRK1YPL141C 2598 nt3.32□□□□□ -1.88
WSC3Q12215 snR38snR38 95 nt3.32□□□□□ -1.88
WSC3Q12215 CDC60YPL160W 3273 nt3.31□□□□□ -1.88
WSC3Q12215 PET111YMR257C 2403 nt3.31□□□□□ -1.88
WSC3Q12215 YDR186CYDR186C 2634 nt3.3□□□□□ -1.88
WSC3Q12215 XRN1YGL173C 4587 nt3.3□□□□□ -1.88
WSC3Q12215 TRM3YDL112W 4311 nt3.3□□□□□ -1.88
WSC3Q12215 STE23YLR389C 3084 nt3.3□□□□□ -1.88
WSC3Q12215 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt3.3□□□□□ -1.88
WSC3Q12215 YGL140CYGL140C 3660 nt3.3□□□□□ -1.88
WSC3Q12215 CHD1YER164W 4407 nt3.3□□□□□ -1.88
WSC3Q12215 MTC4YBR255W 2085 nt3.29□□□□□ -1.88
WSC3Q12215 CAF120YNL278W 3183 nt3.29□□□□□ -1.88
WSC3Q12215 EPL1YFL024C 2499 nt3.29□□□□□ -1.88
WSC3Q12215 NIP1YMR309C 2439 nt3.29□□□□□ -1.88
WSC3Q12215 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt3.28□□□□□ -1.88
WSC3Q12215 CDC53YDL132W 2448 nt3.28□□□□□ -1.89
WSC3Q12215 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt3.27□□□□□ -1.89
WSC3Q12215 HEF3YNL014W 3135 nt3.26□□□□□ -1.89
WSC3Q12215 BUD4YJR092W 4344 nt3.26□□□□□ -1.89
WSC3Q12215 MSH5YDL154W 2706 nt3.26□□□□□ -1.89
WSC3Q12215 LRG1YDL240W 3054 nt3.25□□□□□ -1.89
WSC3Q12215 ARP8YOR141C 2646 nt3.25□□□□□ -1.89
WSC3Q12215 YOR394C-AYOR394C-A 168 nt3.25□□□□□ -1.89
WSC3Q12215 YPR097WYPR097W 3222 nt3.25□□□□□ -1.89
WSC3Q12215 VMR1YHL035C 4779 nt3.24□□□□□ -1.89
WSC3Q12215 TFC4YGR047C 3078 nt3.24□□□□□ -1.89
WSC3Q12215 NUP159YIL115C 4383 nt3.24□□□□□ -1.89
WSC3Q12215 SEC21YNL287W 2808 nt3.23□□□□□ -1.89
WSC3Q12215 RGA1YOR127W 3024 nt3.23□□□□□ -1.89
WSC3Q12215 PET127YOR017W 2403 nt3.23□□□□□ -1.89
WSC3Q12215 VPS16YPL045W 2397 nt3.23□□□□□ -1.89
WSC3Q12215 SET1YHR119W 3243 nt3.23□□□□□ -1.89
WSC3Q12215 PDR3YBL005W 2931 nt3.23□□□□□ -1.89
WSC3Q12215 MDS3YGL197W 4464 nt3.23□□□□□ -1.89
WSC3Q12215 ALY2YJL084C 3141 nt3.22□□□□□ -1.89
WSC3Q12215 ADR1YDR216W 3972 nt3.22□□□□□ -1.89
WSC3Q12215 SLI15YBR156C 2097 nt3.22□□□□□ -1.89
WSC3Q12215 ROM2YLR371W 4071 nt3.22□□□□□ -1.89
WSC3Q12215 XRS2YDR369C 2565 nt3.21□□□□□ -1.9
WSC3Q12215 MYO2YOR326W 4725 nt3.2□□□□□ -1.9
WSC3Q12215 SCD5YOR329C 2619 nt3.2□□□□□ -1.9
WSC3Q12215 FAS1YKL182W 6156 nt3.19□□□□□ -1.9
WSC3Q12215 FIR1YER032W 2631 nt3.19□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 36.1 ms